Plutôt conservateur, il fut l'un des principaux détracteurs de MgrMaurice d'Hulst, recteur de l'Institut catholique de Paris, lorsque celui-ci écrivit un article sur "la question biblique" (Le Correspondant, 170, p. 201–251, ). Moniquet écrivit "Protestation de M l'abbé Moniquet contre le sabotage historique de MgrAlfred Baudrillart dans la vie de Mgr d'Hulst" (Bagnères de Bigorre 1914). Pour avoir modifié la vérité sur cet article d'Hulst. Le recteur était suspecté d'avoir quelques sympathie pour l'abbé Alfred Loisy.
Principales publications
L'Épiscopat français et l'encyclique du , 1866
La Première communiante à l'école du divin maître, lettres sur la vie chrétienne, 1886
Les Idées de M. Alexandre Dumas fils à propos du divorce et de l'homme-femme, 1888
Les Saints de l'archidiocèse de Bordeaux. Saint Fort, premier évêque de Bordeaux et martyr, 1892
Les Saints de l'archidiocèse de Bordeaux. Saint Amand, évêque de Bordeaux au Ve siècle, durant les invasions barbares, 1894
Les Saints de l'archidiocèse de Bordeaux. Saint Seurin, évêque de Bordeaux au Ve siècle, et sa basilique, 1894
Le Rationalisme dans la foi, controverse, 1894
Un mot à M. Émile Zola et aux détracteurs de Lourdes, 1895
Notice sur le R. P. Michel Garicoïts, fondateur de la congrégation des prêtres du Sacré-Cœur établie à Bétharram Basses-Pyrénées, sa vie, ses vertus, ses miracles, sa cause, 1896
Le Cas de M. Henri Lasserre Lourdes-Rome, 1897
La Servante de Dieu Louise-Edmée Ancelot, veuve de maître Charles Lachaud, avocat, 1907
La Divine histoire de Notre-Dame de Lourdes (1858-1911), 1912
Un demi-siècle d'histoire, 1858-1914. La France en péril sous l'étreinte judéo-maçonnique, 1914
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