Affecté à 24 ans aux Marches du Tibet, il mène une vie de privation et se retrouve très isolé au sein de petites communautés chrétiennes.
Plus tard, il a collecté plus de 4 000 spécimens de plantes, dont de nombreuses nouvelles espèces, qui furent envoyés au Muséum national d'histoire naturelle de Paris où Adrien Franchet les a ensuite dénommés et décrits.
Son nom a été attribué à plusieurs plantes dont Abies fargesii, Corylus fargesii, Decaisnea fargesii, Salix fargesii, Rhododendron fargesii ou Clerodendron trichotomum fargesii. Le genre de bambou Fargesia a notamment été nommé ainsi en son honneur.
↑(en) Jane Kilpatrick, Fathers of Botany – The discovery of Chinese plants by European missionaries, Kew Publishing Royal Botanic Gardens, The University of Chicago Press, , 254 p.
Farges est l’abréviation botanique standard de Paul Guillaume Farges.