Le parc est centré autour du lac Göygöl, qui signifie en français « lac bleu »[2]. Le lac provient d'un tremblement de terre en 1139 où le lit de la rivière a été bouché.
Histoire
La région de Göygyöl avec ses forêts environnantes sont reconnues pour leur abondance. Ainsi, l'idée d'établir une réserve sur ce site a émergé dans les années 1910-1912, ce qui a abouti à la création de la première réserve du pays, la réserve naturelle d’État de Göy Göl en 1925. Cette réserve a ensuite été supprimée puis ré-établie en accord avec le public le , avec l'ordre n°475 du ministère soviétique SSR de l’Azerbaïdjan. Le parc national a ensuite été officialisé le sur ordre du président de l’Azerbaïdjan sur les bases de la réserve naturelle de Göygyöl sur le territoire de Khanlar (actuel Göygyöl). Le site a ensuite été agrandi, passant de 6739 hectares à 12 755 hectares[3].