Nitrospinota

Phylum

Nitrospinota
Nitrospinota
Description de l'image Defaut 2.svg.
Classification LPSN
Domaine Bacteria
Règne Pseudomonadati

Phylum

Nitrospinota
Lücker et al. 2021[1]

Synonymes

  • Nitrospinae Lückerr et al. 2013
  • Nitrospinota Park et al. 2020

Les Nitrospinota sont un phylum monotypique du règne des Pseudomonadati, au sein du domaine Bacteria. Son nom provient de Nitrospina qui est le genre type de ce phylum. Ce sont des bactéries marines oxydant le nitrite.

Selon la LPSN ()[2] ce phylum ne comporte qu'une seule classe, les Nitrospinia Lücker et al. 2022.

Historique

Nitrospinota a d'abord été décrit au rang d'ordre en sous le nom de Nitrospinae par Lücker et al. mais ces travaux n'ont pas été publiés de manière valide au sens de l'ICSP[3]. En , c'est au tour de Park et al. de proposer le nouveau nom Nitrospinota pour ce même taxon comme phylum[4], mais là non plus la publication n'a pas été effectuée selon les critères de validité avec entre autres une absence d'explication de la formation du nom et de l'autorité du nom[3]. Ce n'est qu'en que ce nouveau nom est validé, en même temps que la publication de 41 autres phylum bactériens par Oren et Garrity, tout en maintenant l'autorité de nomenclature à Lücker mais assorti de la date de 2021[1],[3].

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie du phylum Nitrospinota est la suivante : Ni.tro.spi.no’ta N.L. fem. n. Nitrospina, genre type du phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe utilisé pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Nitrospinota, le phylum des Nitrospina[1],[3].

Liste des classes

Les Nitrospinota ne comptent donc qu'une seule classe, les Nitrospinia, dont le nom a été publié de manière valide en 2022[5], ainsi qu'un genre publié de manière non valide, Candidatus Nitromaritima et susceptible de représenter un autre classe[3],[6],[7].

Références

  1. ↑ a b et c Oren et Garrity 2021, p. 4.
  2. ↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le .
  3. ↑ a b c d et e (en) « Phylum Nitrospinota », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )
  4. ↑ Park et et al. 2020, p. 1.
  5. ↑ Göker M «  Filling the gaps: missing taxon names at the ranks of class, order and family » Int J Syst Evol Microbiol. 2022;72(12). DOI 10.1099/ijsem.0.005638
  6. ↑ (en) « Genus "Candidatus Nitromaritima" », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )
  7. ↑ (en) David Kamanda Ngugi, Jochen Blom, Ramunas Stepanauskas et Ulrich Stingl, « Diversification and niche adaptations of Nitrospina-like bacteria in the polyextreme interfaces of Red Sea brines », ISME J, vol. 10,‎ , p. 1383–1399 (DOI 10.1038/ismej.2015.214)

Bibliographie

  • (en) A Oren et GM Garrity, « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 71, no 10,‎ , p. 005056 (DOI 10.1099/ijsem.0.005056)
  • (en) Sebastian Lücker, Boris Nowka, Thomas Rattei, Eva Spieck et Holger Daims, « The genome of Nitrospina gracilis illuminates the metabolism and evolution of the major marine nitrite oxidizer », Front. Microbiol., vol. 4,‎ , p. 27 (DOI 10.3389/fmicb.2013.00027)
  • (en) Soo-Je Park, Adrian-Ştefan Andrei, Paul-Adrian Bulzu, Vinicius S. Kavagutti, Rohit Ghai et Annika C. Mosier, « Expanded Diversity and Metabolic Versatility of Marine Nitrite-Oxidizing Bacteria Revealed by Cultivation- and Genomics-Based Approaches », Appl Environ Microbiol, vol. 86, no 22,‎ , p. 1-17 (DOI 10.1128/AEM.01667-20)

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