Après que le Parti communiste de Lituanie a voté pour se séparer du Parti communiste de l'Union soviétique en , il devient le secrétaire général du parti communiste sur la plate-forme PCUS et le , il obtient le titre de premier secrétaire. Le programme politique de son parti indique que l'un de ses objectifs est de maintenir la Lituanie dans le cadre de l'URSS. Le , la Lituanie proclame son indépendance. Le , le Parti envoie un ultimatum au gouvernement de la Lituanie, lui ordonnant de se conformer à l'exigence du président de l'URSS Mikhaïl Gorbatchev et du Conseil suprême afin de rétablir immédiatement la force juridique de l'URSS et de la constitution de la RSS de Lituanie. Ensuite, le Parti créé le "Comité national Lituanien de sauvetage" (lituanien: Lietuvos nacionalinio gelbėjimo komitetas).
Le , des soldats soviétiques prennent d'assaut la tour de Vilnius. Pendant l'attaque, 14 personnes sont tuées et plus de 600 blessées. Ce jour-là, le Procureur général de Lituanie ouvre une procédure pénale en vertu de l'art. 88, partie 2 du Code pénal de la RSS de Lituanie (tentative de coup d'État). Burokevičius est l'un des accusés[1]. Cependant, il n'est pas arrêté, car après l'effondrement de l'URSS, il s'enfuit en Biélorussie[2].
Le , il est arrêté à Minsk (avec son collègue Juozas Jermalavičius) et extradé vers la Lituanie. Cinq autres personnes sont jugées pour leur implication dans ces événements, de à [3]. Le , Burokevičius est condamné pour organisation de meurtres et blessures, création d'organisations anti-étatiques, à 12 ans de prison[4],[5],[6],[7]. Il a été libéré le . Il mort à Vilnius le .
