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Le Musée est connu pour la richesse de ses collections, mais également pour l'offre culturelle proposée. Chaque année des expositions temporaires viennent enrichir le parcours permanent. Pendant les vacances scolaires des ateliers sur les techniques préhistoriques sont proposés au public, ainsi que de nombreuses autres animations.
Le Musée de Tautavel fait partie de l'EPCC CERP de Tautavel (Établissement public de coopération culturelle) qui englobe aussi le Centre Européen de Recherches Préhistoriques, dont la plupart des chercheurs travaillent au sein de UMR 7194 du CNRS qui réunit l'Université de Perpignan - Via Domitia, le département de Préhistoire du MNHN de Paris.
Centre Européen de Recherches Préhistoriques (CERP)
Atelier feu au musée en famille par Julie de Jolies lueurs.
L'AIP est un chantier d'insertion qui fonctionne au sein du musée et du centre de recherches, avec des salariés en insertion travaillant notamment à côté des chercheurs dans les Réserves Archéologiques du CERP, et dans l'Atelier de Moulage. Les productions de l'atelier peuvent être trouvées en vente dans la boutique du Musée.
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