Après avoir été pendant dix ans maître de conférences en histoire moderne à l'Université Paris-I Panthéon-Sorbonne, il est depuis 2004 professeur d’histoire du monde moderne et de la Révolution française à l’université de Rouen, dont il a dirigé le département d'histoire[2] d' à . De cette dernière date à , il a été directeur du GRHis, laboratoire de recherches qui réunit les historiens, historiens de l'art et musicologues de l'Université de Rouen.
Ses recherches et travaux portent sur l’histoire politique et culturelle de la Révolution française, ainsi que sur le théâtre au XVIIIe siècle. Jusqu'en juin 2011, il était par ailleurs directeur des Annales historiques de la Révolution française, seule revue internationale consacrée à la période révolutionnaire. Il a également présidé la Société des études robespierristes, chargée de la publication de cette revue internationale, de 2011 à 2017.
Missionnaires de la République : les représentants du peuple en mission, 1793-1795 (préf. Jean-Clément Martin), Paris, CTHS, coll. « CTHS-histoire » (no 8), , 623 p. (présentation en ligne).
Collot d'Herbois, L’Almanach du père Gérard (1791), réédition bilingue (français et breton) sous la direction et avec des annotations de Gwennolé Le Menn (accompagnée d'une préface et de commentaires de Michel Biard), éditions Skol, coll. « La Bibliothèque bretonne » no 14, Saint-Brieuc, 2003, 517 p., (ISBN2-911647-24-6).
Michel Biard et Pascal Dupuy, La Révolution française : dynamiques, influences, débats, 1787-1804, Paris, Armand Colin, coll. « U », 2004, 347 p., (ISBN2-200-26385-6). – 2e édition, sous le titre : « La Révolution française : dynamique et ruptures, 1787-1804 », : mêmes éditeur et collection, 2008, 352 p., (ISBN978-2-200-35454-1).
Les Lilliputiens de la centralisation : des intendants aux préfets, les hésitations d'un modèle français, Seyssel, Champ Vallon, coll. « La Chose publique », 2007, 410 p., (ISBN9782876734623).
Réédition : Parlez-vous sans-culotte ? Dictionnaire du Père Duchesne (1790-1794), Paris, Points, coll. « Points histoire » (no H440), , 665 p., poche (ISBN978-2-7578-1863-3).
Révolution, Consulat, Empire : 1789-1815 (en collaboration avec Philippe Bourdin et Siliva Marzagalli), Paris, Belin, coll. « Histoire de France » (no 9), , 715 p. (ISBN978-2-7011-3366-9, présentation en ligne).
Procès-verbaux de la Société populaire de Honfleur (1791-1795), Paris, Éditions du CTHS, 2011, 824 p.
1793, le siège de Lyon. Entre mythes et réalités, Clermont-Ferrand, Lemme Éditions, 2013, 120+XVI p.
Réédition : Michel Biard (dir.) (préf. Michel Vovelle), La Révolution française : une histoire toujours vivante, Paris, CNRS Éditions, coll. « Le passé recomposé », , 446 p., poche (ISBN978-2-271-08067-7).