La toponymie de son nom est d'origine française. Il daterait de l'arrivée des premiers colons français à l'époque de la Louisiane française et de la Nouvelle-France. En effet ce lieu était une prairie couverte de fleurs de couleur rouge[1]. Au XIXe siècle, le site du premier village s'appelait Prairie Mer Rouge[2].
À la fin du XIXe siècle, bien que le premier chemin de fer passât par leur village, les habitants ne purent imposer Mer Rouge comme chef-lieu de la paroisse de Morehouse.
En , dans une affaire qui eut un retentissement national, des membres du Ku Klux Klan enlevèrent deux Blancs - Filmore Watt Daniel et Thomas Fletcher Richard - à Mer Rouge. Après les avoir torturés et tués, les hommes du Klan abandonnèrent leurs cadavres près du lac Lafourche. À la suite de ces meurtres, le gouverneur de Louisiane, John M. Parker, demanda l'aide du département fédéral de la Justice pour débarrasser son État de la violence du Klan[3].
↑Samuel Henry Lockett, Louisiana as it is : A Geographical and Topographical Description of the State, Gretna, Pelican Publishing, (lire en ligne), p. 64.
↑Thomas R. Pegram, One Hundred Percent American : The Rebirth and Decline of the Ku Klux Klan in the 1920s, Lanham, MD Ivan R. Dee, 2011, p. 172-174.