Peu de temps après la mort de son mari, Douglas, aux commandes d'un avion ATA le 3 avril 1944, elle meurt dans un accident le 4 août de la même année; avec également à bord sa sœur Kitty qui est blessée. La cause initiale de la mission interrompue est un problème mécanique avec le réservoir de carburant [5],[6]. En raison du manque de carburant, Margaret a été obligée de faire un atterrissage forcé dans le Cheshire qui s'est bien passé jusqu'à ce qu'ils touchent un fossé et qu'elle perde le contrôle lorsque le Percival Proctor se retourne. Elle venait juste de retourner au travail après avoir accouché. Elle et son mari sont le seul couple ATA à partager la même tombe et la même pierre tombale. Ils sont enterrés au cimetière Dunure dans l'Ayrshire [7].
Une compagnie d'autobus de Hatfield a nommé ses huit autobus d'après les «huit premiers» des pilotes de Tiger Moth dans l'ATA, y compris Fairweather[8]. Les quinze femmes membres survivantes de l'ATA (et les 100 hommes pilotes survivants) ont reçu un prix spécial en 2008 par le Premier ministre Gordon Brown[9].
↑A. Mills, Sex, Strategy and the Stratosphere: Airlines and the Gendering of Organizational Culture, Palgrave Macmillan UK, (ISBN978-0-230-59570-5, lire en ligne), p. 94
↑(en) Mary Ellis et Melody Foreman, A Spitfire Girl: One of the World's Greatest Female ATA Ferry Pilots Tells Her Story, Pen and Sword, (ISBN978-1-4738-9539-3, lire en ligne), p. 48