Ensuite, il participa à la Coupe des confédérations 1995. Il fut titulaire dans tous les matchs (Arabie saoudite, Danemark, Nigeria), et lors du 1er tour, le Mexique et le Danemark durent se départager pour voir lequel irait en finale. Marcelino Bernal rata son tir au but, et le Danemark alla en finale. Il termine 3e du tournoi.
Sa dernière compétition internationale est la Coupe du monde de football de 1998, en France. Il ne joue que deux matchs sur les 4 (titulaire contre l'Allemagne, remplaçant contre la Corée du Sud). Le Mexique est sorti dès les huitièmes de finale.