Fils d'un mineur espagnol réfugié en France, il a d'abord joué à Lens avant d'être recruté par le Stade clermontois, club évoluant alors en Division 2. En 1947, il rejoint l'AS Saint-Etienne. Il reste fidèle au club forézien pendant 14 ans. Il évolue pendant huit ans comme intérieur gauche dans l'équipe professionnelle et joue 230 matches en Division 1. À partir de 1955, il devient entraîneur-joueur des amateurs durant six ans. Puis, c'est alors qu'il quitte les verts pour leurs rivaux de toujours: en 1961-1962, il devient entraîneur de l'Olympique lyonnais.
Manu Fernandez est mort le sur la route, au retour d'un match joué par l'équipe de L'Étrat, commune des environs de Saint-Étienne, dont il était entraîneur-joueur.
Marc Barreaud, Dictionnaire des footballeurs étrangers du championnat professionnel français (1932-1997), l'Harmattan, 1997. cf. la fiche du joueur page 148.