La mésofaune est un compartiment de la faune de taille intermédiaire entre la microfaune et la macrofaune.
Le terme est une association du grec mesos, signifiant « médian » ou « au milieu », et du latin scientifique fauna.
La mésofaune désigne l'ensemble des petits animaux dont la taille est comprise entre 0,2 et 4 mm (visible à la loupe) présents dans un espace donné.
Elle est majoritairement constituée d’acariens, de collemboles, et d’autres arthropodes. Leur rôle est la consommation de la litière par fragmentation (rupture des parois/cuticules/exosquelettes) permettant une augmentation de la surface d’échange, l’humidification et la modification de pH.
