Le gouverneur général est le représentant du monarque au Malawi et exerce la plupart de ses pouvoirs. Le gouverneur général est nommé pour un mandat indéfini, servant à la discrétion du monarque. Quand le Malawi obtient son indépendance par la loi de 1964 sur l'indépendance du Malawi, plutôt que d'être d'abord établi en tant que dominion semi-autonome puis promu à l'indépendance telle que définie par le Statut de Westminster de 1931, le gouverneur général doit toujours être nommé uniquement sur l'avis du Cabinet du Malawi sans la participation du gouvernement britannique. Comme le Malawi devient une république avant que Glyn Jones, l'ancien gouverneur colonial, ne soit remplacé, cela ne s'est jamais produit. En cas de vacance, le juge en chef aurait servi d'officier administrant le gouvernement.
En vertu des Constitutions du pays de 1966, 1994 et 1995, le président de la République est le chef exécutif de l'État.
Le premier président, Hastings Kamuzu Banda, est par l'Assemblée nationale et se fait ensuite proclamer président à vie en . Il est défait en 1994, un an après l'abolition de son mandat à vie dans le cadre de la transition du Malawi vers la démocratie. Depuis, les présidents sont élus au suffrage universeldirect pour un mandat de cinq ans. Les présidents peuvent être élus un certain nombre de fois, mais pas plus de deux fois de suite. En cas de vacance, le vice-président devient président pour le reste du mandat.