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Les principaux écrits de Kilian Stobæus ont été rassemblés après sa mort et publiés à Dantzig en 1752, sous le titre Stobæi opuscula. Stobæus a constitué de riches collections, notamment en histoire naturelle, en archéologie et en numismatique et en a fait don à l'Université de Lund en 1735. Un inventaire de ces collections, réalisé un an après sa mort, montre qu'elles comportaient, entre autres, 44 spécimens de poissons, 14 de tortues, 2 de serpents, 3 de crocodiles et 23 d'oiseaux.
(en) Erik Åhlander, Sven O. Kullander & Bo Fernholm (1997). Ichthyological Collection Building at the Swedish Museum of Natural History, Stockholm. in Collection building in ichthyology and herpetology (T.W. Pietsch et W.D. Anderson, dir.), American Society of Ichthyologists and Herpetologists : 13-25. (ISBN0-935868-91-7)