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En tant que défenseur, José Guilherme Baldocchi fut international brésilien qu'une seule fois pour aucun but inscrit. Sa seule sélection fut honorée le à Porto Alegre, contre l'Argentine, qui se solda par une défaite des locaux (0-2). Il fit partie des joueurs sélectionnés pour la Coupe du monde de football de 1970, mais il ne joua aucun match. Il remporta néanmoins le tournoi.