John Joseph Murphy, né le à Chicago, est un nageuraméricain. Lors des Jeux olympiques d'été de 1972 disputés à Munich, il a obtenu la médaille d'or lors du relais 4 × 100 m nage libre accompagnée d'un nouveau record du monde. Après avoir remporté la médaille de bronze lors du 100 mètres dos, il a également terminé quatrième de la finale du 100 mètres nage libre lors de ces mêmes Jeux[1].
Durant la première moitié des années 1970, il a nagé pour l'Université d'Indiana.