Il naît à Morecambe dans le Lancashire, troisième fils et plus jeune des neuf enfants de John et Mary Marr, son père est un banquier aisé de Morecambe. Il étudie à la Grammar School de Lancaster puis entre au St John's College de Cambridge en 1875.
Marr publie son premier article sur la géologie du Lake District en 1878, premier d'une série qui le consacre comme l'un des meilleurs spécialistes de la géologie de cette région de son temps[1].
Il étudie les relations entre paysage et géologie et est l'un des pionniers de ce domaine avec son livre The Scientific Study of Scenery.
↑(en) John Edward Marr : The foremost Lake District geologist of his era, Proceedings of the Cumberland Geological Society, 1998-1999 (2000), 6(3), 361-379.
