Joaquim Santana dispute également avec Benfica la Coupe intercontinentale 1962. Au match aller, il s'incline 3-2 face au club brésilien de Santos[4]. Au match retour, il se fait battre une nouvelle fois (2-5) par le club de l'État de São Paulo[5]. Il inscrit deux buts lors du match aller et un but au match retour, ce qui est malheureusement insuffisant pour donner la victoire à son équipe.
Son palmarès national à Benfica est constitué de sept titres de Champion du Portugal et de deux Coupes du Portugal. Au total, avec Benfica, il dispute 106 matchs en Primeira Divisão, inscrivant 51 buts dans ce championnat[6]. Il réalise sa meilleure saison en 1960-1961, où il inscrit 15 buts[1].
En 1968, Joaquim Santana quitte Benfica et rejoint le SC Salgueiros. Il termine sa carrière au SC Freamunde.
En équipe nationale
Joaquim Santana reçoit cinq sélections en équipe du Portugal[7]. Il inscrit un but en équipe nationale. Il ne participe à aucune phase finale de compétition internationale avec le Portugal.
Il reçoit sa première sélection le , lors d'une victoire face à la Yougoslavie comptant pour les éliminatoires de l'Euro 1960. À cette occasion, il inscrit un but, ce sera son seul but en équipe nationale[8]. Sa dernière sélection a lieu le , lors d'une défaite face à la Bulgarie dans le cadre des éliminatoires de l'Euro 1964[9].
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