Après avoir étudié le droit à Louvain, Maetsuycker est avocat d'abord à La Haye et plus tard à Amsterdam. À partir de 1636, il vit aux Indes orientales néerlandaises.
En 1653, il devient Gouverneur général des Indes néerlandaises, actuelle Indonésie. Il reste à ce poste 25 ans, ce qui est la plus longue durée de tous les gouverneurs-généraux. Sous sa direction, la colonie hollandaise prospère : les Portugais perdent Ceylan (1658), la côte de Coromandel (1658) et la côte de Malabar (1663); Makassar est conquis (1667), la côte ouest de Sumatra occupée, et la première expédition à l'intérieur de Java organisée.