Le président Eisenhower, rencontrant le capitaine de frégate Jean Guillou, le 15 février 1958.
Commandant du sous-marin Rubis de 1946 à 1948, il est désigné le 15 juillet 1948 comme observateur de l'ONU en Palestine, à l'occasion de la bataille de Jérusalem.
Contre-amiral en 1968, il commande le Centre d’Entrainement de la Flotte (CEF) d'octobre 1968 à septembre 1970, avec sa marque sur le bâtiment de ligne Jean Bart, en remplacement du contre-amiral René Sabatier de Lachadenède. A plusieurs reprises, en 1969 et 1970, les chefs d’état-major font appel à lui pour les accompagner lors de visites protocolaires avec les autorités soviétiques.
Vice-amiral d'escadre en 1973[4], il est commandant de l'escadre de l'Atlantique de février 1972 à mai 1974[5], avec sa marque sur le croiseur Colbert, puis président de la commission permanente des essais des bâtiments de la flotte [6],[7],[8]. Il est membre du conseil supérieur de la marine pour 1974[7].
En 1975, après 41 ans de service, dont 26 ans à la mer, il est versé dans la deuxième section des officiers généraux de la marine.
Ses liens avec la Russie permirent le jumelage historique de Toulon avec Kronstadt en 1996[9]. Outre le russe, il parlait anglais et étudiait l'hébreu et le chinois.
Président de l'académie du Var[10], Jean Guillou fut « l'un des initiateurs du mémorial aux sous-mariniers disparus en mer implanté à proximité de la Tour Royale »[11].
↑Le Monde, « • Le général Madon devient inspecteur de l'armée de l'air. L'amiral Storelli reçoit sa cinquième étoile », Le Monde, (lire en ligne, consulté le ).
↑Le Monde, « • Les généraux Thenoz et Vaillant reçoivent leur cinquième étoile. Le contre-amiral de Gaulle commandera le groupe naval d'essais », Le Monde, (lire en ligne, consulté le ).
↑Le Monde, « Le vice-amiral Guillou commandera l'escadre de l'atlantique », Le Monde, (lire en ligne, consulté le ).
↑François Trucy et André Bérutty (préf. Jacques Keriguy), Toulonnais, dits et faits, écrits et portraits : De A à Z, dictionnaire des Toulonnais d'un jour ou d'une vie, La Seyne-sur-Mer, Livres en Seyne, (ISBN9791096694259), p. 209.