Avec l'USG Boulogne et le Stade Portelois, Aubert se forge une réputation de formateur, ayant le « don de repérer qui de ses jeunes pousses pouvait évoluer au haut niveau »[2],[3],[4].
De nombreux hommages lui sont faits, comme à l'US Boulogne, où le Centre technique Jean-Aubert est inauguré en , ainsi qu'au Stade portelois, où le terrain du stade Amour-Sergent porte son nom[3],[4].
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