Né à Porto Rico, Javier Báez déménage en Floride en 2005 avec sa mère, sa sœur et ses frères[2]. Son père, Ángel Luis, de qui les garçons de la famille disent avoir hérité l'intérêt pour le baseball, est décédé quelques années plus tôt alors que le jeune Javier était âgé de 10 ans[3]. Les Báez emménagent en Floride afin de limiter les coûts occasionnés par les fréquents déplacements pour les traitements de Noela, la seule fille de la famille, atteinte de spina bifida[3]. L'aîné de la famille, Rolando Agosto, est joueur de baseball à la position d'arrêt-court et est repêché en 2002 au 15e tour de sélection par les Padres de San Diego[4], pour qui il joue brièvement en ligues mineures en 2002 et 2003[5].
Javier Báez joue au baseball à l'école secondaire Arlington Country Day de Jacksonville, qu'il commence à fréquenter alors qu'il parle à peine l'anglais[2]. Son frère Rolando lui sert souvent d'interprète[6]. Javier Báez est entraîné à cette école par Ron Dickerson, qu'il considère comme un second père[2]. Chacun des frères Báez a un tatouage du logo de la MLB sur la nuque[6].
Carrière
Étudiant à son école secondaire de Jacksonville[4], Javier Báez est le choix de première ronde des Cubs de Chicago et le 9e joueur sélectionné au total lors du repêchage amateur de 2011[7]. Quelques semaines plus tard, Báez accepte le contrat proposé par les Cubs et reçoit une prime à la signature qui s'élève à 2,7 millions de dollars US[8]. Il commence sa carrière professionnelle la même année en ligues mineures et évolue à sa position habituelle, l'arrêt-court, bien qu'on l'essaie éventuellement au deuxième but, un poste qu'il avait déjà occupé à l'école secondaire[9].
Javier Báez est rappelé des ligues mineures par les Cubs pour la première fois le et ses débuts dans le baseball majeur sont prévus pour le lendemain contre les Rockies du Colorado[14]. Son arrivée crée un heureux problème pour les Cubs, qui possèdent une abondance de jeunes talents au milieu de l'avant-champ. Le joueur d'arrêt-court étoile Starlin Castro, âgé de 24 ans[15], est sous contrat avec le club de Chicago jusqu'en 2020[16] mais se dit prêt à être déplacé au deuxième but[17]. Arismendy Alcantara, qui a fait ses débuts dans les majeures trois semaines plus tôt[18], est déplacé du deuxième but au champ centre[14]. Enfin, le deuxième but Darwin Barney, joueur défensif hors pair qui connaît en revanche des ratés en offensive, est échangé aux Dodgers de Los Angeles[19] une semaine avant l'arrivée de Báez. Le scénario le plus probable est de garder Castro à l'arrêt-court et d'utiliser Báez au deuxième coussin[20].
Au camp d'entraînement des Cubs en 2015, Baez est en compétition avec Tommy La Stella et Arismendy Alcantara pour le poste de joueur de deuxième but[23]. Il est assigné aux mineures chez les Cubs de l'Iowa, où il connaît une bonne saison avant de se fracturer un doigt lors d'une tentative de vol de but qui l'envoie le sur la liste des joueurs blessés pour 4 à 8 semaines[24].