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Toutefois, en , la coalition s'effondre et Singh est remplacé par Chandra Shekhar, à la tête d'un gouvernement mené par une scission du Janata Dal, le Samajwadi Janata Party, et soutenu par le Congrès national indien.
Après un passage dans l'opposition entre 1991 et 1996, le Janata Dal est de nouveau au pouvoir au sein de la coalition du Front uni et avec le soutien extérieur du Congrès. H. D. Deve Gowda est Premier ministre jusqu'à ce que le Congrès retire son soutien en 1997. Gowda est remplacé par Inder Kumar Gujral jusqu'en 1998 où ce dernier perd sa majorité parlementaire et le Janata Dal est remplacé au pouvoir par le BJP.
Après sa perte du pouvoir, le Janata Dal subit de nombreuses scissions jusqu'à sa dissolution en 1999. Les partis qui en sont issus sont les suivants :
