Takahashi est originaire de la préfecture de Fukushima, né dans une famille de fidèles orthodoxes orientaux. Son nom "Ibō" était la translittération chinoise de « John. » Son père était un samouraï du domaine Aizu et docteur.
Peu avant l'attaque de Pearl Harbor, Takahashi est commandant en chef de la 3e flotte, comprenant les 5e et 7e escadrons de croiseurs ainsi que les 2e et 4e flottilles de destroyers faisant partie de la Force du sud, commandée par le vice-amiral Nobutake Kondō basée à Taïwan en 1941.
En janvier et , cette force est divisée en forces orientales et centrales; la première pour les invasions de Menado, Kendari et Makassar dans les Célèbes, et les opérations amphibies en mer de Banda, la seconde étant pour l'invasion du Bornéo néerlandais. Takahashi est commandant des forces orientales et centrales lors des invasions de Bali et de Java. Ses forces comprenaient la « Force de soutien direct » du contre-amiral Shōji Nishimura, commandant du 4eescadron de destroyers, la « Deuxième force d'escorte » du contre-amiral Raizo Tanaka, commandant du 2e escadron de destroyers, les 1re et 2e « Forces de la base navale » , sous le vice-amiral Takeo Kurita, la « Troisième escorte », sous le commandement du contre-amiral Chuichi Hara, et le « First Air Group » composé du porte-avions légerRyūjō et de 56 transports.
Suspecté de crimes de guerre, il est arrêté à Tokyo par les forces d'occupation américaines le . Faute de preuves, il est par la suite libéré. Il décède de cause naturelle le à l'âge de 58 ans.
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