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Le 3 juin 2004, les clubs d'Arcachon et de Gujan-Mestras fusionnent pour former le Football Club Bassin d'Arcachon Sud. En juin 2013, une nouvelle fusion a lieu entre le Bassin d'Arcachon Sud et celui de La Teste-de-Buch pour former le club actuel.
En parallèle à la première fusion, Jean-Pierre Papin commence sa carrière d'entraîneur au club à travers ce projet ambitieux. Il y reste 2 saisons de 2004 à 2006. Sous sa conduite, le club accède pour la première fois de son histoire au CFA2 en 2005 et restera à ce niveau jusqu'en 2010. Il redescend alors en Division d'Honneur pendant trois saisons frôlant la relégation au second échelon régional (DHR) en 2013 avant de remonter en CFA 2 en survolant la saison en 2014 sous la direction de Jean-Pierre L'Eglise. Malheureusement, le retour de Jean-Pierre Papin pour la saison en CFA 2 est un échec et l'équipe fait son retour en Division d'Honneur pour 2015-2016, niveau auquel elle se maintient à la fin de cette saison.
Lors de la saison 2018/2019, les dirigeants choisissent l'ancien attaquant international français Steve Savidan (1 sélection) comme entraîneur. Le FCBA évolue alors en Régional 1 (6ème échelon national). L'équipe termine en tête du championnat au terme d'une dernière journée rocambolesque. Menés 3-0 à la 80ème minute en terrain hostile chez le club de Tartas Saint Yaguen, les joueurs se surpassent et s'imposent 4-3 notamment grâce à un triplé de l'ancien international espoir français Marvin Esor (dont deux sur coup franc )
Ce jour la Marmande, Libourne et Arcachon jouaient la montée en N3 mais Le FCBA est donc promu pour la saison 2019/2020.
Dernier de la poule A après 8 journées de championnat N3 2019-2020 (1 victoire, 2 matchs nuls, 5 défaites), Steve Savidan est démis de ses fonctions. Il sera remplacé par Marvin Esor.
A l’issue de la saison 2023/2024, le club est promu en N3 (Nationale 3).
Logo
À l'intersaison 2013, un nouveau logo est utilisé, l'entente du club accueillant en son sein l'entité de La-Teste-de-Buch[1].
Évolution du logo
Logo de 2004 à 2013.
Logo depuis 2013.
Palmarès
Champion DH Aquitaine : 1994, 2005 et 2014
Vainqueur de la Coupe de la Région Aquitaine : 2005
Vainqueur de la Coupe du District Gironde Atlantique : 2005, 2011, 2014, 2016 et 2017
Meilleur parcours en Championnat : Saison 2005/2006 - CFA 2 - Groupe F - 6e
Meilleur parcours en Coupe de France : Saison 2008-2009 - 8e tour