Fanta Diagouraga débute le handball à 8 ans à l’école puis au collège, avant de prendre une licence au club de Saint-Cyr l’École, puis au Paris 92. À 18 ans, elle rejoint le centre de formation de Dijon[5]. Après deux saisons en Bourgogne, elle fait son retour à l'échelon inférieur en 2020 pour le club de Noisy-le-Grand. En 2021-2022, elle est la meilleure marqueuse de la D2, ce qui lui ouvre la porte d'un contrat en D1 à Celles-sur-Belle[5]. Après une première saison réussie dans les Deux-Sèvres, elle prolonge en février 2023 son contrat d'une année supplémentaire[6]. Mais en janvier 2024, elle rejoint la Roumanie et le CSM Deva(ro)[7] en D2 roumaine, puis à l'intersaison le CS Măgura Cisnădie(ro) en D1 roumaine.