La version Deep Thought 0.01 a été créée en mai 1988, et la version 0.02 en novembre de la même année. Cette nouvelle version avait 2 processeurs VLSI (Very Large Scale Integration) conçus spécifiquement, et elle était capable d'analyser 720 000 coups par seconde.
En 1994, Deep Thought 2 a gagné le NACCC pour la cinquième fois, avec un classement Elo estimé à environ 2600. Il a été sponsorisé par IBM. Quelques-uns des ingénieurs qui ont conçu Deep Thought avaient aussi travaillé sur la conception de Deep Thought 2.
Ses algorithmes étaient des fonctions d'évaluations relativement simples, mais Deep Thought pouvait examiner un demi-milliard de positions d'échecs par coup joué lors d'une partie d'échecs en cadence de tournois, ce qui lui permettait d'atteindre une profondeur de 10 ou 11 demi-coups dans des positions complexes. En plus de cela, en utilisant la technique de l'« extension singulière »[4], il pouvait aussi suivre des chemins de coups forcés pour aller encore plus loin, ce qui lui permit de trouver un échec et mat en 19 coups (37 demi-coups)[5].
↑(en) Kevin Maney, Steve Hamm et Jeffrey O'Brien, Making the World Work Better : The Ideas That Shaped a Century and a Company, Pearson Education, , 350 p. (ISBN978-0-13-275513-9, lire en ligne), p. 70.