En mars 2000, Danaher, qui compte 24 000 employés rachète API Motion et la firme suisse Portescap.
En juillet 2014, Siemens vend ses activités en microbiologie à Danaher pour un montant inconnu[6].
En 2011, la société Danaher fait l'acquisition de l'entreprise Beckman Coulter comprenant ainsi toutes ses filiales telles que Immunotech et d'autres...
En septembre 2014, Danaher acquiert les activités de Nobel Biocare, spécialisé dans les implants dentaires, pour 2,2 milliards de dollars[7].
En mai 2015, Danaher annonce l'acquisition de Pall Corp, une entreprise de fabrication de filtres hydrauliques et filtres à air, pour 13,8 milliards de dollars[8]. Danaher annonce également son intention de se scinder en deux :
Une première entité gardera le nom Danaher se spécialisant dans les activités de diagnostics, de tests, identifications médicales, dentaires et de la qualité de l'eau.
La seconde entité portera un nouveau nom et sera une structure diversifiée autour de l'informatique, des télécommunications, de l'automatisation, du stockage pétrolier et des instruments de mesure[8].
En juillet 2016, cette scission est actée, la nouvelle entité prenant le nom de Fortive[9].
En septembre 2016, Danaher annonce l'acquisition pour 4 milliards de dollars, dettes comprises, de Cepheid, une entreprise de diagnostiques à échelle moléculaires et à usage génétiques[10].
En février 2019, General Electric annonce la vente de ses équipements dédiées aux biotechnologies pour 21,4 milliards de dollars à Danaher[11].
En août 2023, Danaher annonce l'acquisition d'Abcam, une entreprise de fabrication de supplémentaires protéiniques, pour 5,7 milliards de dollars, acquisition finalisée en décembre 2023[12],[13].