Parmi ses ouvrages figurent Bach: Essays on His Life and Music (Cambridge, 1991), Mozart's Requiem (Berkeley, 1994), The New Bach Reader (New York, 1998) et Johann Sebastian Bach: The Learned Musician, finaliste de la sélection pour le prix Pulitzer en 2001. (New York, 2000). Il est interrogé sur L'Art de la fugue de Bach dans le documentaire Desert Fugue(en).
Autograph mit einem Kommentar von Christoph Wolff : Johann Sebastian Bach: Messe in h-Moll BWV 232 mit Sanctus in D-Dur (1724) BWV 232 III. Bärenreiter Verlag, Kassel 2009, (ISBN978-3-7618-1578-6).
Christoph Wolff : Johann Sebastian Bach. 2. Aufl. S. Fischer, Frankfurt am Main 2007, (ISBN978-3-596-16739-5).
Christoph Wolff : Mozarts Requiem. Geschichte, Musik, Dokumente. Mit Studienpartitur. 4. korr. Auflage. Bärenreiter, Kassel 1991, (ISBN3-7618-1242-6).