Wenstrup se lance en politique en présentant sa candidature aux élections municipales de 2009 à Cincinnati. Seul candidat contre le maire démocrate sortant Mark Mallory, il est battu par ce dernier[2].
Le , il porte secours à son collègue Steve Scalise, touché lors d'une fusillade à Alexandria pendant un entraînement de l'équipe de baseball du Congrès[5]. Il reçoit en 2018 la Soldier's Medal pour son intervention[6].
Après que les républicains aient repris la majorité à la Chambre des représentants lors des élections de 2022, il devient le président de la commission spéciale sur la pandémie de coronavirus, qui remet en décembre 2024 un rapport sur la réponse à la crise du gouvernement fédéral[8],[9].
Il annonce en novembre 2023 qu'il ne sera pas candidat à un septième mandat lors des élections de 2024[10].