Après des études de théologie en 1772 comme novice chez les Jésuites à Rottweil, puis dans une abbaye à Dillingen, il devient frère Bernhard en rejoignant l'Abbaye de Salem en 1774. À cause de son caractère arrogant et colérique mais aussi de son intelligence, sa période de probation est prolongée d'un an. Le 13 novembre 1776, il peut prononcer ses vœux.
Bernhard Boll devient vite une érudit religieux exemplaire et apprécié. En 1780, il est ordonné prêtre et nommé professeur de philosophie à l'abbaye de Salem et à celle de Tennenbach. En 1805, il enseigne à l'Université de Fribourg-en-Brisgau puis quatre ans plus tard, il est le prêtre de la cathédrale Notre-Dame de Fribourg.
Son épiscopat se passe mal. Boll a des ennuis de santé dus à son âge. Le Grand-duché de Bade affirme sa puissance sur celle de l'Église en se référant à une église d'état basé à Karlsruhe. Ce pouvoir qui se partage entre Constance et Bruchsal ne comprend pas de personnes vraiment religieuses à l'exception de Hermann von Vicari qui sera son successeur. La vie spirituelle et les questions liturgiques se réfèrent davantage à la tradition qu'à la nouvelle curie romaine influencée par les Lumières. Bernhard Boll propose sa démission au pape, il meurt le 6 mars 1836 avant sa réponse.
Christoph Schmider(de): Die Freiburger Bischöfe: 175 Jahre Erzbistum Freiburg. Eine Geschichte in Lebensbildern. Freiburg i. Br.: Herder Verlag, 2002. (ISBN3-451-27847-2).
