Dans son ouvrage paru en 1724, Oud en Nieuw Oost-Indiën vervattende een naaukeurige en uitvoerige verhandelinge van Nederlands mogentheyd in die gewesten, le naturaliste et explorateur hollandais François Valentijn, qui parcourt l'archipel pour évangéliser ses populations, mentionne un village situé à 3 milles en amont d'une rivière qui se jette dans une baie du nom de « Bilipapan ».
Le , l'entreprise Mathilda y effectue un premier forage pétrolier.
Au cours de la Seconde Guerre mondiale, la région de Balikpapan a été le théâtre de deux batailles :
en , la première bataille de Balikpapan, qui permit aux forces japonaises de s'emparer des champs pétrolifères (seulement partiellement endommagés). Le 24 février 1942, 78 personnes sont assassinés sur place par les japonais lors du (en) massacre de Balikpapan. Les victimes sont des civils néerlandais et des prisonniers de guerre.
Le , lors de la bataille de Bornéo, la seconde bataille de Balikpapan (opération « Hautbois Deux »), un vaste assaut amphibie permettant aux Alliés, américano-australiens, d'expulser les Japonais de l'Est de l'île.
La ville est divisée en cinq kecamatan, listés ci-dessous avec leur population correspondante[1]:
Name
Population Recensement de 2010
Balikpapan Selatan (Balikpapan Sud)
191,737
Balikpapan Timur (Balikpapan Est)
60,664
Balikpapan Utara (Balilpapan Nord)
123,214
Balikpapan Tengah (Balikpapan Centre)
98,552
Balikpapan Barat (Balikpapan Ouest)
83,412
Économie
Balikpapan est depuis longtemps un des centres pétroliers de l'Indonésie. Il est toujours le deuxième (après la province de Riau à Sumatra). C'est aussi un port important, qui exporte notamment du charbon et du bois.
Elle offre également un potentiel touristique, notamment comme point de départ pour visiter l'intérieur du Kalimantan oriental.
Une dizaine de projets immobiliers et hôteliers de grande importance à l'échelle de la ville sont à l'étude tel le « Grand Sudirman Balikpapan ».
La richesse pétrolière dans la région a suscité l'implantation de nombreuses compagnies pétrolières, dont le groupe Total, qui possède des bureaux à Balikpapan.
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