En 1427 Jacques II d'Écosse intervient dans le nord de l'Écosse et convoque à Inverness une cinquantaine de chefs des Highlands dont son cousin Alexandre II MacDonald, Angus Dubh MacKay et ses 4 fils, Kenneth Mor MacKenzie de Kintail, John Ross of Balnagowan, William Leslie, Angus Moray de Culbin Alexandre MacRuari, John MacArthur et James Campbell. Il les fait emprisonner et exécute plusieurs d'entre eux dont James Campbell qu'il avait chargé d'arrêter, l'oncle d'Alexandre II, Ian Mor Tanisteir MacDonald, chef du Clan MacDonald de Dunnyveg qui avait été tué dans des conditions mystérieuses lors de l'intervention.
En 1431Donald Balloch, fils de Iain Mor que ses parents du clan Maclean avaient caché à Mull conteste la trop grande soumission selon lui de son cousin et se révolte. Il défait Alexandre Stuartcomte de Mar, Alan Stuart comte de Caithness qui est tué, Huntly et Fraser envoyés contre lui à Inverlochy près du loch Linnhe. Lorsque le roi réussit à reprendre la situation en main Donald Balloch s'enfuit en Irlande où il trouve refuge chez Conn O'Neill d'Edenduffcarrick au Connacht dont il épouse la fille Johanna.
Lorsque le roi Jacques Ier, réclame la tête du rebelle aux Irlandais une tête coupée méconnaissable lui est présentée par Hugh O'Neill. Donald Balloch échappe toutefois à la mort il retourne en Écosse après le meurtre du roi en 1437 et il ne meurt que vers 1476.
Comte de Ross
Le roi Jacques Ier d'Écosse conscient qu'il ne pourra pas obtenir la soumission des MacDonald par la force décide de relâcher Alexandre II MacDonald qui est pardonné à Perth en 1431. Sa mère Mary ou Mariota Leslie étant morte en 1436 il décide sans doute alors de lui concéder le titre de comte de Ross qu'Alexandre II porte dès janvier1437 avant le meurtre du roi le 21 février suivant.
Cette fonction lui permet d'étendre son autorité sur ses domaines de Seigneur des Îles et de comte de Ross en mettant au pas quelques clans récalcitrants et de traiter a parité avec les autres grands seigneurs écossais comme le comte de Douglas et le comte de Crawford avec lesquels il conclut un accord offensif et défensif en 1445/1446.
Lorsque Alexandre II MacDonald meurt à Dingwall le il n'est pas inhumé comme ses ancêtres à Iona mais dans l'église des chanoines de Ross, la cathédrale de Fortrose
Union et postérité
Alexandre II MacDonald épouse avant 1431 Elizabeth Seton dont:
(en) Mike Ashley The Mammoth Book of British Kings & Queens Robinson (Londes 1998) (ISBN1841190969) « John II, Angus Og Donald Dubh (The Black) » p. 539-541 et table généalogique n° 39 p. 537.