Elle a pour frère Guillaume V de Nevers († 1181), qui hérite des comtés de Nevers et d'Auxerre (le comté de Tonnerre reste à sa mère Mathilde) à la mort de son père en 1176 et meurt en 1181.
Son père meurt alors qu'elle n'a que 6 ans. Agnès et son frère deviennent alors pupilles du roi[2].
Héritant des comtés de Nevers et d'Auxerre à l'âge de 10 ans à la suite de la mort de son frère Guillaume V en 1181, elle est d'abord fiancée à Olivier « Albus », seigneur de Grignon († 1181/84). Olivier mort, le roi Philippe Auguste arrange son mariage en 1184 - elle a 14 ans - avec Pierre II de Courtenay.
Fondations religieuses, actes
En 1185, Agnès et son mari Pierre confirment par charte les privilèges de l'église Saint-Étienne de Nevers, et le ils renoncent par charte à leurs droits héréditaires en faveur de Saint-Cyr.
En 1191, ils achètent Tonnerre à sa mère Mathilde de Bourgogne[1].
Mort
Elle meurt le 2 ou [3] à l'âge de 22 ans, pendant que son mari combat en Terre Sainte avec la troisième croisade, laissant une fille, Mathilde (1188 † 1257), comtesse de Nevers, d'Auxerre et de Tonnerre, qui sera mariée en 1199 à Hervé IV de Donzy († 1222), puis en 1226 à Guigues IV de Forez († 1241).
« Pierre de Courtenay, son of Pierre de France […] m(arried) firstly (1184) Agnès Ctss de Nevers, d'Auxerre et de Tonnerre, daughter of Guy [I], comte de Nevers, d'Auxerre et de Tonnerre & his wife Mathilde de Bourgogne Dame de Montpensier. [Capet] ([1170]-[Mailly] 2 or 6 Feb 1193). The Chronologia Roberti Altissiodorenses records that "Philippus Rex" arranged the marriage of "Guidonis Comitis filiam" and "Petro patrueli suo", and installed him as Comte de Nevers […]
Trad. : Pierre II de Courtenay, fils de Pierre de France(lui-même 6e fils de Louis le Gros) […] épousa en premier Agnès, comtesse de Nevers, d'Auxerre et de Tonnerre, fille de Guy, comte de Nevers, d'Auxerre et de Tonnerre & de sa femme Mathilde de Bourgogne Dame de Montpensier [Capet] ([1170]-[Mailly] 2 or 6 fév. 1193). La Chronologia Roberti Altissiodorenses note que "Philippus Rex" arrangea le mariage de "Guidonis Comitis filiam" et "Petro patrueli suo" (Pierre son père), et l'installa comme Comte de Nevers […] »
« The Chronologia Roberti Altissiodorenses records that "Guido comes" left two children by his wife "Mathildis", stating that they became wards of the king after their father died. » (Trad. : « La Chronologia Roberti Altissiodorenses note que "Guido comes" laissa deux enfants par sa femme "Mathildis", affirmant qu'ils devinrent pupilles du roi après la mort de leur père.) »