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L'épreuve du 5 000 mètres masculin des championnats du monde de 2009 a eu lieu les 20 et 23 août 2009 dans le Stade olympique de Berlin. Elle est remportée par l'Éthiopien Kenenisa Bekele.

Critères de qualification

Pour se qualifier (minima A), il faut avoir réalisé moins de 13 min 20 s du 1^er janvier 2008 au 3 août 2009. Le minima B est de 13 min 29 s.

Rang	Athlète	Nationalité	Temps	Notes
	Kenenisa Bekele	Éthiopie	13 min 17 s 09
	Bernard Lagat	États-Unis	13 min 17 s 33
	James Kwalia C'Kurui	Qatar	13 min 17 s 78
4	Moses Ndiema Kipsiro	Ouganda	13 min 18 s 11	SB
5	Eliud Kipchoge	Kenya	13 min 18 s 95
6	Ali Abdosh	Éthiopie	13 min 19 s 11
7	Mohammed Farah	Royaume-Uni	13 min 19 s 69
8	Matthew Tegenkamp	États-Unis	13 min 20 s 23
9	Vincent Kiprop Chepkok	Kenya	13 min 21 s 31
10	Jesús España	Espagne	13 min 22 s 07
11	Chakir Boujattaoui	Maroc	13 min 23 s 05
12	Chris Solinsky	États-Unis	13 min 25 s 87
13	Joseph Ebuya	Kenya	13 min 39 s 59
14	Anis Selmouni	Maroc	13 min 44 s 59
15	Teklemariam Medhin	Érythrée	13 min 44 s 65
16	Collis Birmingham	Australie	13 min 55 s 58

DNF : N'a pas terminé (did not finish)
DNS : N'a pas pris le départ (did not start)
DQ : Disqualification (disqualification)
NM : Essai non réussi (No Mark)
Q : Qualifié « directement » au prochain tour (ou à la prochaine compétition), lors d'une compétition majeure, grâce au classement ou à la réalisation des minima (automatic qualifier)
q : Qualifié au prochain tour (ou à la prochaine compétition), lors d'une compétition majeure, grâce au repêchage ou à la réalisation de l'une des meilleures performances parmi celles des « non qualifiés directement » (grâce au meilleur temps ou à la meilleure distance par exemple) (secondary qualifier)