Nykyinen Tsukuban yliopisto on perustettu lokakuussa 1973, mutta sen edeltäjä (jap.東京教育大学, Tōkyō kyōiku daigaku) (engl.Tokyo University of Education)[1] perustettiin alkujaan nimellä Tokyo Shihan Gakko vuonna 1872, ja se on siten Japanin vanhimpia yliopistoja.[3]