Heinimäki on käsikirjoittanut Aira Samulinin elämäntarinaan perustuvaan elokuvaan Tango Kabaree (2001) sekä Mikko Kuustosen elämäkerran Q – lauluntekijän tarina (2006). Hän on kirjoittanut myös uskonnon oppikirjoja lukioon ja peruskouluun sekä kolumneja Kotilieteen, Metro-lehteen, Viini-lehteen ja ExpressBussiin.
Heinimäki oli valtakunnallisen sosiaali- ja terveysalan eettisen neuvottelukunnan ETENE:n kaudella 2006–2010 aluksi varajäsen ja siirtyi varsinaiseksi jäseneksi tammikuussa 2010.[4] Kauden 2010–2014 hän oli varsinainen jäsen[5] ja kauden 2014–2018 varapuheenjohtaja.[6]
Heinimäki oli yksi WSOY:n kirjallisuussäätiön palkinnon saajista vuonna 2009. Vuonna 2010 hänelle myönnettiin Luterilaisen kulttuurin säätiön tunnustuspalkinto ja vuonna 2011 Kirkon tiedonvälityspalkinto.[7]
Heinimäki soittaa mandoliinia ja banjoa Petty Pilgrims folk-yhtyeessä. Yhtyeen ensilevy Eedeniksi luultiin (Turenki Records) ilmestyi vuonna 2015.[8]
Teokset
Pieni mies jalustalla. Kertomuksia pyhimyksistä ja sankareista. (Kuvat: Ismo Rekola) Helsinki: Like, 1994. ISBN 951-578-169-8
Pyhiä naisia ja muita pyhimysesseitä. (Kuvat: Ismo Rekola) Helsinki: Like, 1995. ISBN 951-578-247-3
Seitsemän syntiä. Sisäisen sankarivainajan sielunavaus. Helsinki: Like, 1999. ISBN 951-578-656-8
Pyhä nauru. Kirjoituksia huumorista ja uskonnosta. Helsinki: Like, 2000. ISBN 951-578-791-2
Harrasta viiniä. Makuja ja tarinoita, pulloja ja pyhimyksiä. (Viiniarviot: Antti Rinta-Huumo. 2. uudistettu painos (1. painos 1999)) Helsinki: Kirjapaja, 2001. ISBN 951-625-790-9 (kirjan uudistettu kolmas painos julkaistiin vuonna 2013)
Heinimäki, Jaakko & Tissari-Simola, Virpi: Harrasta ruokaa: Jokapäiväistä leipää arkeen ja pyhään. Helsinki: Kirjapaja, 2003. ISBN 951-607-012-4
Vapahtajan varpajaiset. Helsinki: Johnny Kniga, 2003. ISBN 951-0-28276-6
Nuotiokirja. Ruokaa ja tarinoita tuleen tuijottajille. Helsinki: WSOY, 2005. ISBN 951-0-30140-X
Valot päälle. Raamatun tarinoita lapsille. Lapua: Herättäjä-yhdistys, 2005. ISBN 951-878-098-6
Pieni maustekirja. (Reseptit: Henry Tikkanen. Teksti: Jaakko Heinimäki) Helsinki: Hummeri, 2005. ISBN 952-99183-2-1
Kuustonen, Mikko & Heinimäki, Jaakko: Q. Lauluntekijän tarina. Helsinki: WSOY, 2006. ISBN 951-0-30905-2
Heinimäki, Jaakko ym.: Napapaju. Sekovartisia selityksiä. (Piirrokset: Matti Pikkujämsä) Helsinki: Otava, 2007. ISBN 978-951-1-21068-9
Pyhät ystäväni. (Kuvittanut Katja Tukiainen) Helsinki: Otava, 2007. ISBN 978-951-1-22015-2
Heinimäki, Jaakko & Kalliala, Kaarlo & Sisättö, Vesa: Pihlajanorsu. Selkärangattomia selityksiä. (Piirrokset: Matti Pikkujämsä) Helsinki: Otava, 2008. ISBN 978-951-1-22297-2
Heinimäki, Jaakko & Jolkkonen, Jari: Luterilaisuuden ABC. Synkkä ja harmaa sanakirja. (Logos) Helsinki: Edita, 2008. ISBN 978-951-37-5290-3
Suomen lasten Raamattu. (Teksti: Jaakko Heinimäki. Kuvitus: Christel Rönns) Helsinki: Otava, 2009. ISBN 978-951-1-22845-5
↑ abcPaavilainen, Ulla (päätoim.): Kuka kukin on: Henkilötietoja nykypolven suomalaisista 2015, s. 175–176. Helsinki: Otava, 2014. ISBN 978-951-1-28228-0