Isosaaren vankileiri aloitti toimintansa 15. toukokuuta 1918.[1] Se kuului Santahaminan vankileirin tavoin Suomenlinnan vankileirin alaisuuteen.[2] Leirille sijoitettiin venäläisiä sotilaita sekä valkoisten "poliittisesti erittäin vaarallisina" pitämät punaiset, jollaisia olivat esimerkiksi Suomen kansanvaltuuskunnan hallinnossa toimineet tai muutoin julkisuudessa olleet.
Sota-arkiston tietojen mukaan Isosaaren vankileirillä kuoli teloituksiin, nälkään ja kulkutauteihin 267 sisällissodan punakaartilaista sekä lisäksi 69 venäläistä sotilasta.[4] Joidenkin tietojen mukaan kuolleita olisi ollut yhteensä noin 360.[1]
Lähes kaikki Isosaaren vankileirillä kuolleet haudattiin Santahaminassa sijaitsevaan joukkohautaan, koska kallioiselle Isosaarelle oli vaikea kaivaa.[4]Suomen sotasurmat -tietokannan mukaan Isosaarelle haudattiin vain kahdeksan vainajaa.[3] Heidän muistokseen saarelle pystytettiin muistomerkki vuonna 1955.[4] Se sijaitsee todennäköisesti juuri Isosaaren joukkohaudan paikalla.[1]