Küng osallistui asiantuntijana Vatikaanin toiseen kirkolliskokoukseen (1962–1965). Samoihin aikoihin hän alkoi hahmotella katolisen kirkon uudistusohjelmaa, jonka päämääräksi hän asetti ekumeenisen avartumisen, papiston pakollisesta selibaatista luopumisen sekä sukupuolten välisen tasa-arvon, johon sisältyisi myös naisten mahdollisuus pappisvihkimykseen. Hän asetti kyseenalaiseksi paavin erehtymättömyyden sekä katolisen kirkon kategorisen abortti- ja ehkäisykiellon.
Saksan katolinen piispainkokous epäsi 1979 Küngiltä kirkollisen opetusluvan (missio canonica) tämän kirkkokriittisten julkaisujen takia. Küng menetti professuurinsa katolisessa tiedekunnassa, mutta Küng oli suosittu luennoitsija eikä Tübingenin yliopisto halunnut menettää häntä. Küngiä varten perustettiin ekumeenisen teologian professuuri. Küng toimi myös ekumeenisen tutkimusinstituutin johtajana Tübingenin yliopistossa emeritoitumiseensa saakka 1996. Hän ei koskaan palannut katoliseen oppituoliin.
Kirjassaan Projekt Weltethos Küng lähtee hahmottelemaan maailmanlaajuista etiikkaa, maailmaneetosta, jonka voisivat hyväksyä sekä eri uskontojen kannattajat että ei-uskonnolliset ihmiset. Ajatus tulee esille myös Maailman uskontojen parlamentin julistuksessa 1993, johon Küng kirjoitti pohjatekstin. Julistuksessa suurten maailmanuskontojen edustajat ilmaisivat ensimmäistä kertaa yksimielisyytensä maailman etiikan periaatteista. Vuodesta 1995 lähtien Küng oli perustamansa Maailmaneetos-säätiön (Stiftung Weltethos) presidentti.
2009 Abraham-Geiger-palkinto (Potsdamin yliopisto) teoksesta ’’Judentum’’
Kirjallisuutta
Valikoima Hans Küngin pääteoksia
Küng, Hans: Unfehlbar? Eine Anfrage. Zürich: Benziger, 1970. (saksaksi)
Küng, Hans: Christ sein. München: Piper, 1974. ISBN 3-492-02090-9. (saksaksi)
Küng, Hans: Ewiges Leben?. München: Piper, 1982. ISBN 3-492-02806-3. (saksaksi)
Küng, Hans: Existiert Gott? Antwort auf die Gottesfrage der Neuzeit. München: Piper, 1978. ISBN 3-492-02333-9. (saksaksi)
Küng, Hans: Projekt Weltethos. München: Piper, 1990. ISBN 3-492-03426-8. (saksaksi)
Küng, Hans: Das Judentum. Die religiöse Situation der Zeit. München: Piper, 1991. ISBN 3-492-03496-9. (saksaksi)
Küng, Hans: Das Christentum: Wesen und Geschichte. Die religiöse Situation der Zeit. München: Piper, 1994. ISBN 3-492-03747-X. (saksaksi)
Küng, Hans: Der Islam: Geschichte, Gegenwart, Zukunft. Die religiöse Situation der Zeit. München: Piper, 2004. ISBN 3-492-04647-9. (saksaksi)
Hans Küngin suomennetut teokset
Küng, Hans: Mikä on kirkko?. (Was ist Kirche?, 1970.) Suomentanut Taisto Nieminen. Helsinki: Kirjapaja, 1975. ISBN 951-621-142-9.
Küng, Hans: Kristityn 20 teesiä. (20 Thesen zum Christsein, 1975.) Suomentanut Eero Huovinen. Porvoo: WSOY, 1976. ISBN 951-0-07727-5.
Küng, Hans & Kuschel Karl-Josef (toim.): Elämää säilyttävät arvot: Maailman uskontojen parlamentin julistus ja sen tausta. Suomentanut Taisto Nieminen; suomeksi toimittanut Reijo E. Heinonen. Helsinki: Arator, 1994. ISBN 952-9619-06-5.
Küng, Hans (toim.): Vastuun aika: Puheenvuoroja eettisestä maailmanjärjestyksestä. (Ja zum Weltethos, 1995.) Suomentanut Taisto Nieminen; suomeksi toimittanut Reijo E. Heinonen. Oulu: Pohjoinen, 1997. ISBN 951-749-282-0.
Hans Küngin teologiaa käsitteleviä suomalaisia teoksia
Cantell Risto & Huovinen Eero & Salo, Simo S.: Kirkon ykseys ja reformi: Hans Küngin herättämä ekumeeninen keskustelu. Helsinki: Missiologian ja ekumeniikan seuran julkaisuja 25, 1974. ISBN 951-95205-0-3. .