منشأ ویندوز ۳٫۰ زمانی بود که گروهی از برنامه نویسان مایکروسافت در سال ۱۹۸۹ بهطور مستقل و آزمایشی تصمیم به توسعه حالت محافظت شدهٔ ویندوز گرفتند. نمونه اولیه آنها آماده ارائه به مدیران شرکت شد که به اندازه کافی مورد تأیید آنها قرار گرفت تا به عنوان یک پروژه رسمی تصویب شود.