این مسابقات اولین رقابت‌های سراسری در ایران بود که بعد از هشت سال برگزار می شد. به دلیل جنگ ایران و عراق شرایط برای مسابقات منظم لیگ به هیچ عنوان مهیا نبود ،به خصوص که عراق در بمباران شهرهای ایران رخداد بمباران زمین فوتبال چوار را هم رقم زده بود. اما جام حذفی با حضور ۲۴ تیم که قهرمان باشگاههای هر استان بودند به سرعت برگزار و قهرمان مشخص می شد. از شگفتی های این جام شکست پرسپولیس تهران مقابل خیبر خرم آباد بود که با این پیروزی خیبر به دیدار پایانی راه یافت اما تیمی که جام را تصاحب کرد ملوان بندر انزلی بود که با ۲ گل شکست خیبر را رقم زد و اولین قهرمان ایران بعد از انقلاب شد.ملوانان که برای دومین بار قهرمان این دوره از رقابت‌ها می شدند به عنوان تنها قهرمان کشور به مسابقات جام باشگاههای آسیا ۱۹۸۶ راه پیدا کردند. مسابقات جام حذفی سال ۱۳۶۵ رفت و برگشت برگزار نمی‌شد و فقط با انجام یک بازی کار انتخاب تیم برنده پایان می‌یافت که میزبان آن یک بازی با انجام قرعه مشخص می‌گردید. خیبر پس از غلبه بر پرسپولیس تا فینال جام حذفی پیش رفت و در بازی نهایی که در ورزشگاه شهید شیرودی تهران برگزار شد، با دو گل محمد احمدزاده و سیروس قایقران با نتیجه ۲ بر صفر بازی را به ملوان انزلی واگذار کرد و نایب‌قهرمان جام حذفی کشور شد.
مرحله یک هشتم نهایی
تاریخ
میزبان
نتیجه
میهمان
۲۴تیر ۱۳۶۵
تام اصفهان
۰(۵)-(۴)۰
(در ضربات پنالتی تام اصفهان ۵ بر ۴ پیروز شد و به دور بعد صعود کرد)
نفتون مسجد سلیمان
پنالتی های تام:
جلال فولادگر
احمدرضا عابدزاده
غلام جهان نما
محمود امام‌دوست
اسدالله قوامی
پنالتی های نفتون:
عطاالله بهادری
الیاس اروانه
خلیل خدادادی
بهمن اسدی شیخ‌رباط
متحد همدان
۱ - ۲
خیبر خرم آباد
استقلال بندر ترکمن
۰ - ۲
پیروزی تهران
مرحله یک چهارم نهایی
تاریخ
میزبان
نتیجه
میهمان
توضیحات
۳۱ تیر ۱۳۶۵
خیبر خرم آباد
۱ - ۰
پیروزی تهران
رضا محمدی اصل
ورزشگاه تختی خرم آباد
تماشاگر:
۲۰۰۰۰ نفر
مرحله نیمه نهایی
تاریخ
میزبان
نتیجه
میهمان
۷ مرداد ۱۳۶۵
خیبر خرم آباد
۳ - ۱
پاس بوشهر
ملوان انزلی
۳ - ۲
تام اصفهان
نادر عزت اللهی
فینال
تاریخ
میزبان
نتیجه
میهمان
توضیحات
۱۴ مرداد ۱۳۶۵
ملوان انزلی
۲ - ۰
خیبر خرم آباد
ورزشگاه شیرودی (تهران)
سیروس قایقران
محمد احمدزاده
سرمربی ملوان: بهمن صالح نیا
بازیکنان خیبر خرم آباد: حسن رستمی، حسن حسین‌بیگی، هدایت علایی، موسی کرکی، احمد جاودانه، فضل‌الله حیدری، احمد سهرابی، علی‌مردان بهاروند، رضا محمدی اصل، غلام بیرانوند و کرم عباسی
