آنالیز دنباله

هدف از آنالیز دنباله در زیست‌شناسی در اختیار خود درآوردن یک دی‌ان‌ای یا دنبالهٔ پپتیدی برای تنظیم دنباله، پایگاه‌های دادهٔ دنباله، تحقیقات دنباله‌ای تکرار شده یا دیگر روش‌های بیوانفورماتیکی بر روی یک رایانه است.

از آنجا که گسترش روش‌های با بیشترین خروجی محصول از دنباله ژن‌ها و پروتئین‌ها، نسبت افزایش دنباله‌های جدید به پایگاه‌های داده به صورت پیوسته افزایش می‌یابد. یک چنین گردایه از دنباله‌ها به خودی خود فهم دانشمندان از زیست‌شناسی موجودات زنده را افزایش نمی‌دهند. اگرچه مقایسه دنباله‌ها با عملکردهای شناخته شده با این دنباله‌های جدید یک راه فهمیدن زیست‌شناس آن موجودات زنده‌است که از دنباله‌های جدید می‌آیند؛ بنابراین آنالیز دنباله می‌تواند برای مشخص کردن عملکرد ژن‌ها و پروتئین‌ها به وسیلهٔ مطالعه همانندی بین دنباله‌های مقایسه شده‌استفاده شود. امروزه ابزارها و تکنیک‌های زیادی وجود دارند که مقایسهٔ دنباله‌ها (تنظیم دنباله) را تهیه می‌کنند و محصول تنظیمی را برای فهمیدن زیست‌شناسی آن آنالیز می‌کنند.

آنالیز دنباله در زیست‌شناسی مولکولی و بیوانفورماتیک‌ها بر اساس آزمایش‌های کامپیوتری از قطعه‌های مشخص برای مثال یک دی ان ای استاندارد مکانیزه شده‌است.

آن شامل موضوعات مربوطه‌است. ۱: مقایسهٔ دنباله‌ها به منظور فهمیدن همانندی و غیر همانندی در دنباله‌های مقایسه شده (تنظیم دنباله). ۲: معرفی ساختارهای ژنی، مطالعهٔ کالبدها، توزیع‌های اینترونی، اگزونی و عناصر تنظیمی. ۳: پیدا کردن و مقایسه حد جهش‌ها یا چند ریختی نوکلئوتید تنها در موجودات زنده به منظور گرفتن یک شاخص ژنتیکی. ۴: معلوم کردن تکامل و تنوع ژنتیکی موجودات زنده. ۵:تفسیر عملکرد ژن‌ها. در شیمی، آنالیز دنباله شامل تکنیک‌های استفاده شده برای معین کردن دنباله‌ای از پلیمر شکل گرفته از چندین مونومر می‌شود در زیست‌شناسی مولکولی و ژنتیکی همان پروسه به‌طور ساده «ترتیب دهی» نام دارد. در بازاریابی، تحلیل دنباله اغلب به صورت تحلیلی در کاربردهای مدیریتی روابط مشتری استفاده می‌شود، همانند مدلهای NPTB. ref/> Durbin, Richard (1998). Biological sequence analysis: probalistic models of proteins and nucleic acids> Cambridge, UK: Cambridge University Press. ISBN 0-521-62971-3.

تحلیل دنباله در زیست‌شناسی مولکولی

زیر رشته‌های علمی

تنظیم دنباله

تنظیم دنباله یک راه چیدن دنباله‌های DNA RNA یا دنباله‌های پروتئین برای معرفی مناطق مشابه‌است. به‌طور کلی به دو بخش تقسیم می‌شود: تنظیم جفتی: تنظیم بین دو دنباله. تنظیم چندتایی: تنظیم بین بیش از دو دنباله. روش‌های موجود برای تنظیم جفتی شامل موارد زیر است: الگوریتم needle man-wunsch، الگوریتم smith-waterman و BLAST روش‌های موجود برای تنظیم چندتایی شامل موارد زیر است: ClustalW, PROBCONS, MUSCLE, MAFFT, DIALIGN, T-Coffee, POA, MANGO.

اصل پیدا کردن

اصل پیشگویی

روش‌شناسی

وظایفی که در فضای تحلیل دنباله قرار دارند اغلب برای حل کردن بدیهی نیستند و به استفاده از روش‌های نسبتاً پیچیده نیاز دارند. به دلیل تنوع زیاد متدهای استفاده شده در عمل رایج ترین‌ها شامل موارد زیراند. شبکه عصبی مصنوعی مدل مارکو مخفی دستگاه بردار پایه دسته‌بندی (خوشه بندی) شبکه Bayesian تحلیل برگشتی

جستارهای وابسته

پیوند به بیرون

منابع

Durbin, Richard (1998). Biological sequence analysis: probalistic models of proteins and nucleic acids. Cambridge,UK: Cambridge University Press. ISBN 0-521-62971-3.

Read other articles:

У Вікіпедії є статті про інших людей з таким ім'ям: Гай. Гай Фонтей АгріппаНародився 15(0015)Помер 70Мезія·загинув у битвіПідданство Римська імперіяДіяльність політик, військовий очільникЗнання мов латинаПосада консул-суффектТермін 58 рікПопередник Нерон Клавдій Цезар Авг...

 

ألساندرو كوستاكورتا (بالإيطالية: Alessandro Costacurta)‏  معلومات شخصية الميلاد 24 أبريل 1966 (العمر 57 سنة)جيراغو كون أوراجو  الطول 1.83 م (6 قدم 0 بوصة)[1][1] مركز اللعب مدافع الجنسية إيطاليا  الزوجة مارتينا كولمباري (2004–)  مسيرة الشباب سنوات فريق 1979–1986 إيه سي ميلا...

 

Cuộc khủng hoảng tài chính Nga năm 2014[1][2][3] là kết quả của sự suy giảm nhanh chóng giá trị của đồng rúp Nga đối với các đồng tiền khác trong năm 2014 và suy thoái trong nền kinh tế Nga.[3][4] Hai trong số những yếu tố chính góp phần vào sự suy giảm kinh tế Nga là do việc các nước phương Tây áp đặt trừng phạt kinh tế do sự can thiệp quân sự của Nga ở U...

Kodi RamakrishnaKodi Ramakrishna Nagabharanam Movie Audio Launch, 2017Lahir(1949-07-23)23 Juli 1949Palakollu, Andhra Pradesh, IndiaMeninggal22 Februari 2019(2019-02-22) (umur 69)Hyderabad, IndiaKebangsaanIndiaPekerjaanSutradara, penulis, aktorTahun aktif1982-2019Kota asalHyderabadSitus webwww.kodiramakrishna.in Kodi Ramakrishna (bahasa Telugu: కోడి రామకృష్ణ; 23 Juli 1949 – 22 Februari 2019) adalah seorang sutradara dan penulis film In...

 

第二十四屆冬季奧林匹克運動會冬季兩項女子4×6公里接力比賽比賽場館张家口市国家冬季两项中心日期2022年2月16日参赛选手80位選手,來自20個國家和地區冠军成绩1:11:03.9奖牌获得者01 ! 琳·佩尔松莫娜·布罗尔松汉娜·厄贝里埃爾薇拉·厄貝里  瑞典02 ! 伊琳娜·卡扎克維奇克里斯季娜·雷茲佐娃斯韋特蘭娜·米羅諾娃烏利亞娜·尼格馬圖林娜  俄罗斯奥林匹克委员...

 

2016 board game Mechs vs. MinionsDesignersChris Cantrell, Rick Ernst, Stone Librande, Prashant Saraswat, Nathan TirasPublishersRiot GamesPlayers2 to 4Playing time60 to 120 minutesChanceMediumSkillsResource management, Planning Mechs vs. Minions is a 2016 cooperative board game published by Riot Games set in the League of Legends universe.[1][2][3][4][5][6] Gameplay Components Mechs vs. Minions is a cooperative game, where players support each ot...

Family of DNA viruses Herpesviridae Virus classification (unranked): Virus Realm: Duplodnaviria Kingdom: Heunggongvirae Phylum: Peploviricota Class: Herviviricetes Order: Herpesvirales Family: Orthoherpesviridae Subfamilies and genera See text Herpesviridae is a large family of DNA viruses that cause infections and certain diseases in animals, including humans.[1][2][3] The members of this family are also known as herpesviruses. The family name is derived from the Gree...

 

Televised Iranian talent show competition New EraGenreRealityTalent contestCreated byEhsan Alikhani[1]Directed byEhsan AlikhaniPresented by Ehsan Alikhani JudgesSeason 1 and 2 Amin Hayai Roya Nonahali Bashir Hosseyni Arya Azimi-nezhad Season 3 Amin Hayai Zhaleh Sameti Karen Homayounfar Majid Esmaeili Country of originIranOriginal languagePersianNo. of seasons3ProductionProducer Ehsan Alikhani Running time60–130 minutesProduction companyIRIBOriginal releaseNetworkIRIB TV3Release16 Fe...

 

2019 book by Elizabeth Wein A Thousand Sisters: The Heroic Airwomen of the Soviet Union in World War II AuthorElizabeth WeinCountryUnited StatesLanguageEnglishGenreNon-fictionPublisherBalzer + BrayPublication dateJanuary 22, 2019Pages384ISBN978-0-06-245301-3A Thousand Sisters: The Heroic Airwomen of the Soviet Union in World War II is a 2019 young adult non-fiction book by Elizabeth Wein. It tells the story of the three female Soviet aircrew regiments organized by Marina Raskova in World War ...

Combat Outpost/Firebase WildernessGerda Serai District, Paktia Province, Afghanistan A M777 155 mm howitzer being sling-loaded to a CH-47 Chinook helicopter at Combat Outpost Wilderness, Afghanistan, Oct. 31, 2013Combat Outpost/Firebase WildernessCoordinates33°17′N 69°13′E / 33.28°N 69.22°E / 33.28; 69.22TypeFire Support BaseSite informationControlled by United States United States ArmySite historyBuilt2006 (2006)Built bySpecial Tr...

 

American model and actress (born 1953) Kathy ShowerShower c. 2005Playboy centerfold appearanceMay 1985Preceded byCindy BrooksSucceeded byDevin DeVasquezPlayboy Playmate of the Year1986Preceded byKaren VelezSucceeded byDonna EdmondsonPersonal detailsBornKathleen Ann Williamson (1953-03-08) March 8, 1953 (age 70)Brookville, OhioHeight5 ft 9 in (1.75 m) Kathleen Ann Shower[1] (born March 8, 1953 as Kathleen Ann Schrauer) is an American model and actress. Known a...

 

Horse fair in County Galway, Ireland Ballinasloe Horse FairAonach na gCapallBronze sculpture in reference to the Ballinasloe Horse FairGenreHorse fairFrequencyAnnually; 1st Sunday of OctoberLocation(s)Ballinasloe, County GalwayCountryIrelandYears active301 years, 2 months and 3 daysAttendance40,000 to 80,000[1][2]Websiteballinasloeoctoberfair.com The Ballinasloe Horse Fair (Irish: Aonach na gCapall) is a horse fair which is held annually at Ballinasloe, the seco...

Untuk kapal lain dengan nama serupa, lihat kapal Jepang Kaga. JDS Kaga (DDH-184) adalah kapal induk helikopter (resmi diklasifikasikan oleh Jepang sebagai kapal perusak helikopter) dan kapal kedua dibangun di kelas Izumo dari Angkatan Laut Bela Diri Jepang.[1][2][3] Namanya berasal dari Provinsi Kaga (加賀国code: ja is deprecated , Kaga no kuni) yang pada masa kini bernama Prefektur Ishikawa. Referensi ^ 海自のヘリコプター搭載護衛艦、「かが」と...

 

Jorge Ortiz de Pinedo Información personalNombre de nacimiento Jorge Ortiz De Pinedo PallásNacimiento 26 de marzo de 1948 (75 años) Ciudad de México, MéxicoNacionalidad MexicanaReligión CatólicaFamiliaPadres Lupita Pallás, Óscar Ortiz de PinedoCónyuge María Esther Gutiérrez Puerta (matr. 1975; div. 1990)Luigina Tuccio Fantoni (matr. 1998; div. 2005)Hijos Óscar Ortiz de Pinedo GutiérrezPedro Ortiz de PinedoJesús Ortiz de PinedoMar...

 

1978 studio album by Dan Fogelberg and Tim WeisbergTwin Sons of Different MothersStudio album by Dan Fogelberg and Tim WeisbergReleasedAugust 1978[1]Recorded1978StudioRecord Plant (Sausalito)The Village (Westwood)Wally Heider (Los Angeles)United (Hollywood)A&M (Hollywood)Sunset Sound (Los Angeles)[1]GenreRock, soft rock, jazz, classicalLength34:32LabelFull Moon, EpicProducerDan Fogelberg, Tim WeisbergDan Fogelberg and Tim Weisberg chronology Twin Sons of Different ...

United States historic placePark TowerU.S. National Register of Historic Places Location2440 Sixteenth St., NW Washington, D.C.Coordinates38°55′19″N 77°2′14″W / 38.92194°N 77.03722°W / 38.92194; -77.03722Built1928-1929ArchitectWilliam HarrisArchitectural styleArt DecoMPSApartment Buildings in Washington, DC, MPSNRHP reference No.89001744 [1]Added to NRHPOctober 30, 1989 The Park Tower is an historic structure located in the Adams Morg...

 

Mexican artist Reid with one of her pieces at the Salón de la Plástica Mexicana María Luisa Reid (full name María Luis Reid Rodríguez; b. November 18, 1943) is a Mexican artist from Zacatepec in the state of Morelos. She is a member of the Salón de la Plástica Mexicana. She studied decorating and interior design at IPAE from 1960 to 1963. She took classes in wood carving at the Escuela Nacional de Artes Plásticas from 1964 to 1966, classes in painting from 1967 to 1969 and classes in ...

 

Species of bird Fox's weaver Specimen in Nairobi National Museum Conservation status Near Threatened (IUCN 3.1)[1] Scientific classification Domain: Eukaryota Kingdom: Animalia Phylum: Chordata Class: Aves Order: Passeriformes Family: Ploceidae Genus: Ploceus Species: P. spekeoides Binomial name Ploceus spekeoidesC. H. B. Grant & Mackworth-Praed, 1947 Fox's weaver (Ploceus spekeoides) is a species of bird in the family Ploceidae. It is endemic to Uganda. Its natural habi...

  Rosa 'Princess Alexandra of Kent' Rosa 'Princess Alexandra of Kent' rosa híbrido con ascendentes parentales de cruce de planta de semillero x planta de semillero.TaxonomíaReino: PlantaeSubreino: TracheobiontaDivisión: MagnoliophytaClase: MagnoliopsidaOrden: RosalesFamilia: RosaceaeSubfamilia: RosoideaeTribu: RoseaeGénero: RosaEspecie: R. 'Princess Alexandra of Kent' híbrido con ascendentes parentales de cruce de planta de semillero x planta de semillero.Obtentor conseguido por Dav...

 

Sporting event delegationBurma at the1956 Summer OlympicsIOC codeBIRin Melbourne/StockholmCompetitors11 in 4 sportsMedals Gold 0 Silver 0 Bronze 0 Total 0 Summer Olympics appearances (overview)19481952195619601964196819721976198019841988199219962000200420082012201620202024 Burma competed at the 1956 Summer Olympics in Melbourne, Australia. Athletics Main article: Athletics at the 1956 Summer Olympics Men Track & road events Athlete Event Heat Quarterfinal Semifinal Final Result Rank Resul...

 

Strategi Solo vs Squad di Free Fire: Cara Menang Mudah!