سوفو

SUFU
ساختارهای موجود PDB جستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB فهرست شناسه‌های PDB 1M1L, 4BL8, 4BL9, 4BLA, 4BLB, 4BLD, 4KM8, 4KM9, 4KMD, 4KMH
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگر	SUFU, PRO1280, SUFUH, SUFUXL, SUFU negative regulator of hedgehog signaling, JBTS32
شناسه‌های بیرونی	OMIM: 607035 MGI: 1345643 HomoloGene: 9262 GeneCards: SUFU
موقعیت ژن (موش) کروموزوم کروموزوم ۱۹ (موش)[۱] نوار 19 C3|19 38.85 cM شروع 46,385,335 bp[۱] پایان 46,477,243 bp[۱]
الگوی گسترش RNA More reference expression data
هستی‌شناسی ژن عملکرد ملکولی • beta-catenin binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • transcription factor binding • signal transducer activity • GO:0001948، GO:0016582 پیوند پروتئینی • protein kinase binding ترکیبات سلولی • سیتوزول • مژک • ciliary base • ciliary tip • هسته یاخته • سیتوپلاسم فرایند زیستی • skeletal system development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ventricular septum development • smoothened signaling pathway involved in ventral spinal cord interneuron specification • negative regulation of smoothened signaling pathway involved in dorsal/ventral neural tube patterning • spinal cord dorsal/ventral patterning • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • coronary vasculature development • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of osteoblast differentiation • پروتئین‌کافت • heart looping • aorta development • neural tube closure • determination of left/right symmetry • smoothened signaling pathway involved in spinal cord motor neuron cell fate specification • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0072468 ورارسانی پیام • skin development • multicellular organism development • cytoplasmic sequestering of transcription factor • negative regulation of protein import into nucleus • negative regulation of smoothened signaling pathway منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
گونه‌ها	انسان	موش
Entrez	51684	24069
آنسامبل	ENSG00000107882	ENSMUSG00000025231
یونی‌پروت	Q9UMX1	Q9Z0P7
RefSeq (mRNA)	NM_001178133، NM_016169، XM_011539858، XM_011539860، XM_011539861، XM_011539863، XM_047425335، XM_047425336، XM_047425337، XM_047425338، XM_047425339 XM_011539864، NM_001178133، NM_016169، XM_011539858، XM_011539860، XM_011539861، XM_011539863، XM_047425335، XM_047425336، XM_047425337، XM_047425338، XM_047425339	NM_015752 NM_001025391، NM_015752
RefSeq (پروتئین)	NP_057253، XP_011538160، XP_011538162، XP_011538163، XP_011538165، XP_011538166، XP_016871812 NP_001171604، NP_057253، XP_011538160، XP_011538162، XP_011538163، XP_011538165، XP_011538166، XP_016871812	NP_056567 NP_001020562، NP_056567
موقعیت (UCSC)	ن/م	Chr : 46.39 – 46.48 Mb
جستجوی PubMed	[۲]	[۳]
ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسان مشاهده/ویرایش موش

پروتئین سرکوبگر همولوگ ادغام‌شده (انگلیسی: Suppressor of fused homolog) مشهور به سوفو (Sufu) یک پروتئین است که در انسان توسط ژن «SUFU» کُدگذاری می‌شود.^[۴][۵] این ژن بر روی بازوی بلند کروموزوم ۱۰ واقع شده و ۱۲ اگزون دارد. در زیست‌شناسی مولکولی، دومِـین این پروتئین نقش مهمی در سلول ایفا می‌کند. سوفو در تنظیم معکوس یک مسیر پیام‌رسانی سلولی مهم، موسوم به مسیر سیگنال‌دهی خارپشتی (HH) نقش اساسی دارد. این مسیر خاص در رشد رویان جانوری بسیار مهم است. چندین همولوگ از سوفو وجود دارد که در طیف گسترده‌ای از جانداران یافت می‌شود.

جهش در ژن‌های کُدکننده اجزای مسیر سیگنال‌دهی خارپشتی برای رشد طبیعی مخرب است و با سندرم‌های زمینه‌ساز سرطان از جمله هولوپروزنسفالی، سندرم کارسینومای سلول بازال نووید و سندرم سفالوپلی‌سینداکتیلی گریگ (GCPS) مرتبط است^[۵] و نقش مهمی هم در سرکوب تومور دارد. به‌طور دقیق‌تر، سوفو یک ژن سرکوبگر تومور است که تغییر در آن افراد را مستعد به مدولوبلاستوما می‌کند، زیرا باعث تغییراتی در مسیر سیگنال‌دهی خارپشتی می‌شود.^[۶] دومِـین پایانه-N، که این مدخل به آن اشاره دارد، حاوی فاکتورهای رونویسی «Gli» است.^[۷] سوفو با مولکول‌های GLI1^{[۸][۹][۱۰]} و GLI3^[۱۱] تعامل پروتئین-پروتئین دارد.

منابع

1. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000025231 - Ensembl, May 2017
2. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
3. "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
4. Merchant M, Vajdos FF, Ultsch M, Maun HR, Wendt U, Cannon J, Desmarais W, Lazarus RA, de Vos AM, de Sauvage FJ (Sep 2004). "Suppressor of fused regulates Gli activity through a dual binding mechanism". Mol Cell Biol. 24 (19): 8627–41. doi:10.1128/MCB.24.19.8627-8641.2004. PMC 516763. PMID 15367681.
5. "Entrez Gene: SUFU suppressor of fused homolog (Drosophila)".
6. Taylor MD, Liu L, Raffel C, Hui CC, Mainprize TG, Zhang X, Agatep R, Chiappa S, Gao L, Lowrance A, Hao A, Goldstein AM, Stavrou T, Scherer SW, Dura WT, Wainwright B, Squire JA, Rutka JT, Hogg D (July 2002). "Mutations in SUFU predispose to medulloblastoma". Nat. Genet. 31 (3): 306–10. doi:10.1038/ng916. PMID 12068298. S2CID 6882566.
7. Das D, Finn RD, Abdubek P, Astakhova T, Axelrod HL, Bakolitsa C, et al. (2010). "The crystal structure of a bacterial Sufu-like protein defines a novel group of bacterial proteins that are similar to the N-terminal domain of human Sufu". Protein Sci. 19 (11): 2131–40. doi:10.1002/pro.497. PMC 3005784. PMID 20836087.
8. Stone DM, Murone M, Luoh S, Ye W, Armanini MP, Gurney A, Phillips H, Brush J, Goddard A, de Sauvage FJ, Rosenthal A (December 1999). "Characterization of the human suppressor of fused, a negative regulator of the zinc-finger transcription factor Gli". J. Cell Sci. 112 (23): 4437–48. doi:10.1242/jcs.112.23.4437. PMID 10564661.
9. Kogerman P, Grimm T, Kogerman L, Krause D, Undén AB, Sandstedt B, Toftgård R, Zaphiropoulos PG (September 1999). "Mammalian suppressor-of-fused modulates nuclear-cytoplasmic shuttling of Gli-1". Nat. Cell Biol. 1 (5): 312–9. doi:10.1038/13031. PMID 10559945. S2CID 6907964.
10. Dunaeva M, Michelson P, Kogerman P, Toftgard R (February 2003). "Characterization of the physical interaction of Gli proteins with SUFU proteins". J. Biol. Chem. 278 (7): 5116–22. doi:10.1074/jbc.M209492200. PMID 12426310.
11. Humke EW, Dorn KV, Milenkovic L, Scott MP, Rohatgi R (April 2010). "The output of Hedgehog signaling is controlled by the dynamic association between Suppressor of Fused and the Gli proteins". Genes Dev. 24 (7): 670–82. doi:10.1101/gad.1902910. PMC 2849124. PMID 20360384.

برای مطالعهٔ بیشتر

• Kogerman P, Grimm T, Kogerman L, et al. (1999). "Mammalian suppressor-of-fused modulates nuclear-cytoplasmic shuttling of Gli-1". Nat. Cell Biol. 1 (5): 312–9. doi:10.1038/13031. PMID 10559945. S2CID 6907964.
• Stone DM, Murone M, Luoh S, et al. (2000). "Characterization of the human suppressor of fused, a negative regulator of the zinc-finger transcription factor Gli". J. Cell Sci. 112 (23): 4437–48. doi:10.1242/jcs.112.23.4437. PMID 10564661.
• Murone M, Luoh SM, Stone D, et al. (2000). "Gli regulation by the opposing activities of fused and suppressor of fused". Nat. Cell Biol. 2 (5): 310–2. doi:10.1038/35010610. PMID 10806483. S2CID 31424234.
• Delattre M, Briand S, Paces-Fessy M, Blanchet-Tournier MF (2001). "The Suppressor of fused gene, involved in Hedgehog signal transduction in Drosophila, is conserved in mammals". Dev. Genes Evol. 209 (5): 294–300. doi:10.1007/s004270050255. PMID 11252182. S2CID 42211231.
• Cheng SY, Bishop JM (2002). "Suppressor of Fused represses Gli-mediated transcription by recruiting the SAP18-mSin3 corepressor complex". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (8): 5442–7. Bibcode:2002PNAS...99.5442C. doi:10.1073/pnas.082096999. PMC 122788. PMID 11960000.
• Taylor MD, Liu L, Raffel C, et al. (2002). "Mutations in SUFU predispose to medulloblastoma". Nat. Genet. 31 (3): 306–10. doi:10.1038/ng916. PMID 12068298. S2CID 6882566.
• Dunaeva M, Michelson P, Kogerman P, Toftgard R (2003). "Characterization of the physical interaction of Gli proteins with SUFU proteins". J. Biol. Chem. 278 (7): 5116–22. doi:10.1074/jbc.M209492200. PMID 12426310.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
• Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). "The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment". Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
• Paces-Fessy M, Boucher D, Petit E, et al. (2004). "The negative regulator of Gli, Suppressor of fused (Sufu), interacts with SAP18, Galectin3 and other nuclear proteins". Biochem. J. 378 (Pt 2): 353–62. doi:10.1042/BJ20030786. PMC 1223961. PMID 14611647.
• Taylor MD, Zhang X, Liu L, et al. (2004). "Failure of a medulloblastoma-derived mutant of SUFU to suppress WNT signaling". Oncogene. 23 (26): 4577–83. doi:10.1038/sj.onc.1207605. PMID 15077159.
• Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). "The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 10". Nature. 429 (6990): 375–81. Bibcode:2004Natur.429..375D. doi:10.1038/nature02462. PMID 15164054.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
• Lyle R, Radhakrishna U, Blouin JL, et al. (2006). "Split-hand/split-foot malformation 3 (SHFM3) at 10q24, development of rapid diagnostic methods and gene expression from the region". Am. J. Med. Genet. A. 140 (13): 1384–95. doi:10.1002/ajmg.a.31247. PMID 16691619. S2CID 24199907.