Kool asutati 1857 Varbla vallakoolina. 1910 muudeti kool Varbla ministeeriumikooliks.[2] Riik andis 1912. aastal loodud kooli ehitamiseks 2000 rubla ja sisustuse valmistamiseks 500 rubla, muud kulud kattis Saulepi vald. Kokku maksis koolimaja valmimine 6800 rubla.[3]
1940 töötas kooli juures Varbla Tütarlaste Täienduskool, kus õpetas Adele Sillenberg.[2]
1962 muudeti kool Varbla 8-klassiliseks kooliks. 1988 muudeti kool Varbla 9-klassiliseks kooliks. 1991 sai kooli nimeks Varbla Põhikool.[2]
2009 hakkas kooli juures tegutsema ka Varbla Lasteaed. 2016 liideti Varbla Lasteaed Varbla Põhikooliga ja uue asutuse nimeks sai Varbla Kool.[2]
Alates 31. augustist 2024 jätkab Varbla Kool kuueklassilisena ja koolieelse lasteasutusena.[4] Õpilaste vanemad kaebasid valla otsuse kohtusse.[5]