Ta töötab 1986. aastast Imperial College Londoni füüsikaosakonnas, kus 1999. aastal sai vanemteaduriks ja hiljem sai temast teoreetilise füüsika professor.[1][2]
Teadustöö
1998. aastal töötas ta koos Andreas Albrechtiga välja valguse muutuva kiirusega kosmoloogilise teooria. Suurenenud valguse kiirus universumi alguses võib lahendada horisondi ja muud kosmoloogilised probleemid ilma inflatsioonita. Sarnase teooria pakkus välja 1993. aastal John Moffat, kuid toona jäi see suures osas tähelepanuta. Magueijo avaldas 2003. aastal oma teooriast populaarteadusliku raamatu.
Teosed
Faster than the Speed of Light: The Story of a Scientific Speculation, Basic Books, 2003, ISBN 978-07382-0525-0.
A Brilliant Darkness: The Extraordinary Life and Disappearance of Ettore Majorana, the Troubled Genius of the Nuclear Age, Basic Books, 2009/2010, ISBN 978-0-465-00903-9.
Bifes Mal Passados: Passeios e outras catástrofes por terras de Sua Majestade, Gradiva, 2014, ISBN 978-989-616-583-3. Autor kirjeldas oma tähelepanekuid Ühendkuningriigi kohta. Ta iseloomustas Briti kultuuri kui üht "kõige mädanenumat ühiskonda maailmas".[3] Briti inimesi kirjeldati kui "pidurdamatuid metsloomi". Raamat ilmus vaid Portugalis, kus seda müüdi 20 000 eksemplari.[4]