Aastatel 1986–1994 õppis Metsoja Tallinna Sõle Gümnaasiumis ja 1994–1997 Tallinna 21. keskkoolis. Aastatel 1997–2002 õppis ta Tartu Ülikoolissemiootikat ja kulturoloogiat. 2007. aastal lõpetas ta samas bakalaureuseõppe bioloogia erialal. 2010. aastal kaitses ta bioloogias magistritööd "Alam-Pedja looduskaitseala Emajõe-äärsete lamminiitude taimestiku mitmekesisust mõjutavad tegurid" [1] ja sai loodusteaduse magistriks. 2016. aastal kaitses ta väitekirja "Taimkattemuutused luhtadel: niitmise ja jõesetete ladestamise mõju" ning sai doktorikraadi.
