Ebola viirus

Ebola viirus
Taksonoomia
Riik	Viirused Virus
Selts	Mononegavirales
Sugukond	Filoviirused Filoviridae
Perekond	Ebolavirus
Liik	Ebola viirus

Ebola viirus ehk Zaire Ebola viirus (lühend ZEBOV, EBOV, EBO-Z) on viiruseliik.

Ebola viirus avastati hemorraagilise palaviku epideemia ajal Ebola jõe äärses külas (Zaires) 1976. aastal.^[1]

2014. aasta Ebola viirushaiguse epideemia käivitanud ebolaviiruse alltüübil oli aprilli 2014 seisuga Ebola viirusega 98% homoloogia.^[2]

Juuni seisuga on ebolaepideemia põhjustajaks siiski ZEBOV.^[3]

Laboratooriumides paljundatud, töödeldavad ja säilitatavad Ebola viiruse tüved on klassifitseeritud bioloogiliste relvade 4. kategooriasse.

Klassifikatsioon

Zaire Ebola viirusel on tuvastatud järgmised alatüübid:

• Zaire ebolavirus Mayinga (ZEBOV-May)
• Zaire ebolavirus Eckron (ZEBOV-Eck)
• Zaire ebolavirus Gabon (ZEBOV-Gab)
• Zaire ebolavirus Zaire (ZEBOV-Zai)
• Zaire ebolavirus Kikwit (ZEBOV-Kik)
• Zaire ebolavirus Tandala (ZEBOV-Tan).

Baltimore'i klassifikatsioonis klassifitseeritakse Ebola viirus miinusahelaliste RNA-viiruste (-)ssRNA rühma.

Valgud

Ebola viiruse valgud

Ebola viiruse genoom kodeerib 7 : NP, VP35, VP40, GP, VP30, VP24, L ja eritab valke: (sGP, delta-peptide, GP₁, GP_{(1,2 delta)}, ssGP).

Peremeesrakku sisenemise tagab EBOV glükoproteiin GP_1,2, ühinedes raku pinnal olevate retseptoritega. EBOV neelatakse alla makropinotsütoosi ajal raku endoplasmas leiduvate põiekeste poolt, tähtsat rolli selle juures mängivad GP1/NPC1 valgu interaktsioonid. Nende interaktsioonid tulemusel sünteesitakse rakuga ühinemiseks sobiv glükoproteiin tagamaks, ka endosomaalsete ensüümide katepsiin B ja L kaudu, EBOV sisenemise rakumembraani kaudu, kus EBOV nukleokapsiid VP30 valk vabastatakse raku tsütoplasmasse, sünteesimaks uusi täiesti nakatumisvõimelisi viirusi.^[4]

Täpseid rakutuumas toimuvaid transkriptsiooni ja paljunemise mehhanisme ei tunta, arvatakse, et need võivad sarnaneda sugukondadesse Paramyxoviridae ja Rhabdoviridae liigitatud viiruseliikide omadega.

Uurijad on tuvastanud, et Ebola viiruse valgud VP24 ja VP35 blokeerivad peremeesorganismi interferooni (IFN)-alfa/beeta sünteesi ja signaali edastamist IFN-alfa/beeta ja IFN-gamma retseptoritele^[5] ning takistavad bioloogiliste vahendajaainete signaalide saatmist rakutuuma ^[6] ja osalevad seeläbi kaasasündinud immuunsuse inhibeerimises. VP35 mängib olulist rolli viiruse transkriptsioonil ja paljunemisel.

Täiesti nakatumisvõimelised viirusosakesed (virionid) vabastatakse 'puhkemise' (ingl k budding) rakumembraani kaudu.

VP24

Mitmed uurijad on tuvastanud, et Ebola viiruse valgud VP24 ja VP35 mängivad olulist rolli peremeesorganismi immuunsüsteemi 'eksitamisel'.

Ajakirjas Cell Host & Microbe avaldatud uurimuses on Amarasinghe ja Daisy Leung näidanud, kuidas VP24 seondub tihedalt nucleus transporter'iga ('tuumatransporteriga') – valguga, mis juhib molekulid rakutuuma ja sellest välja. Molekulide, mida nimetatud transporterid tuuma juhivad, hulgas on STAT1 (signaali ülekande ja transkriptsiooni aktivaator ehk faktor (immunoloogia)), mida peetakse interferooni signaalirajal oluliseks koostisosaks.

“Harilikult transporditakse STAT1 tuuma, selles aktiveerib ta geene sadade valkude jaoks, mis on tegevad antiviraalsete vastuse tekkel,” kirjutab Leung. “Kuid kui VP24 on seondunud mõningate transporteritega, võib juhtuda, et STAT1 ei jõua tuuma.”

See uuring näitas, et VP24 tegevus takistab spetsiifiliselt STAT1 transporti.^[7]

Peremeesorganismid

Looduslikud Ebola viiruse reservuaarid on käesoleval ajal tundmata. Peremeesorganismide osas puudub teadlaste hulgas üksmeel, kuid on tuvastatud, et viirus eluneb asümptomaatiliselt osadel nahkhiirtel ning sümptomaatiliselt sigadel ja osadel ahvidel ning inimestel.

Uurijad on pakkunud välja mitmeid nakkuse ülekandumise hüpoteese.

Arvatakse, et Ebola viirusega võivad Aafrikas nakatuda (erinevad nakatumisteed) ja levitada ka koerad ja sead. Loomade nakkuskandlust esineb mitmetel infraseltsi Anthropoidea liigitatud loomadel^[8] nagu rannikugorilladel, šimpansidel^[9] ja mandrillidel.

Arvatakse, et metsloomad (näiteks antiloobid, mitmed esikloomalised ja närilised (näiteks okassealised) jt ning kodusead ja koerad võivad nakatuda mitmete taimtoiduliste nahkhiirte väljaheidetega kokkupuutunud puuvilju, taimestikku või viirustega kokkupuutunud liha süües ning osad nahkhiired (Hypsignathus monstrosus, Epomops franqueti ja Myonycteris torquata^[10]) võivad Ebola viiruse looduslikeks reservuaarideks olla (uuringu käigus tuvastati Ebola viiruse geenide fragmente).

Ebola viiruse nukleotiidisekventsi fragmente on tuvastatud ka mitmel Mus setulosus'el ja perekonna Praomys esindajatel ning Sylvisorex ollula'l, kuid kuna viirust ennast ei tuvastatud, siis pole selge, kas ka need loomad võivad olla Ebola viiruse looduslikeks reservuaarideks.^[11]

Väljaspool organismi on viirus tavatemperatuuridel nakkusohtlik mitu päeva, −70 °C on viiruseosakesed üsna stabiilsed.^[12]

Immunopatoloogia

 Pikemalt artiklis Ebola viirushaigus

Ebola viirus võib inimestel tekitada hemorraagilist viiruspalavikku.

Ebola viirust tuvastavad maailmas üksnes kindla ohutusklassiga laborid. Eestis haiglad ja Terviseameti laborid Ebola viirust analüüsida ei suuda ja vajaduse tekkimisel saadetaks Eesti proovid lepingupartnerile Rootsi nakkushaiguste instituudile Smittskyddsinstitutet.^[13]

Ebola viirus paljuneb edukalt dendriitrakkudes, ilma et vabastataks tsütokiine. Infitseerunud dendriitrakkude küpsemine ebaõnnestub ja ebaõnnestub ka immuunvastus, kuna ei esitleta antigeene NK-, T- ja B-rakkudele, aidates kaasa Ebola-viirusnakkuse levikule organismis.

Vaata ka

• CAd3-ZEBOV

Viited

1. Report of an International Commission, Ebola haemorrhagic fever in Zaire, 1976, Bulletin of the World Health Organization, 56 (2): 271–293 (1978) (vaadatud 08.08.2014)(inglise keeles)
2. WHO, Ebola virus disease: background and summary. Disease Outbreak News, Global Alert and Response (GAR) (vaadatud 08.08.2014)(inglise keeles)
3. Sébastien Calvignac-Spencer, Jakob M. Schulze, Franziska Zickmann, Bernhard Y. Renard, Clock Rooting Further Demonstrates that Guinea 2014 EBOV is a Member of the Zaïre Lineage, 16. juuni 2014 (vaadatud 11.08.2014)(inglise keeles)
4. Lisa M. Johansen, Jennifer M. Brannan, Sue E. Delos, Charles J. Shoemaker, Andrea Stossel, Calli Lear, Benjamin G. Hoffstrom, Lisa Evans DeWald, Kathryn L. Schornberg, Corinne Scully, Joseph Lehár, Lisa E. Hensley, Judith M. White, ja Gene G. Olinger, FDA-Approved Selective Estrogen Receptor Modulators Inhibit Ebola Virus Infection, Sci Transl Med. Jun 19, 2013; 5(190): 190ra79., doi:10.1126/scitranslmed.3005471, PMCID: PMC3955358, NIHMSID: NIHMS559803 (vaadatud 20.09.2014)(inglise keeles)
5. Christopher F. Basler ja Gaya K. Amarasinghe, Evasion of Interferon Responses by Ebola and Marburg Viruses, J Interferon Cytokine Res., september 2009; 29(9): 511–520., doi:10.1089/jir.2009.0076, PMCID: PMC2988466 (vaadatud 18.09.2014)(inglise keeles)
6. Michael C. Purdy, Study reveals how Ebola blocks immune system, 13. august 2014 (vaadatud 17.08.2014)(inglise keeles)
7. Michael Purdy-WUSTL, 14. august 2014, THIS PROTEIN MAY EXPLAIN WHY EBOLA IS SO DEADLY, WASHINGTON UNIVERSITY IN ST. LOUISrightOriginal Study (vaadatud 12.01.2016)(inglise keeles)
8. Weingartl HM, Nfon C, Kobinger G., Review of Ebola virus infections in domestic animals., Dev Biol (Basel). 2013;135:211-8. doi: 10.1159/000178495., 14. mai 2013 (vaadatud 06.08.2014) (inglise keeles)
9. Peter D Walsh, Roman Biek, Leslie A Real, Wave-Like Spread of Ebola Zaire, 25. oktoober 2005, DOI: 10.1371/journal.pbio.0030371 (vaadatud 13.08.2014)(inglise keeles)
10. WHO, Ebola virus disease, Fact sheet N°103, Aprill 2014 (vaadatud 10.08.2014)(inglise keeles)
11. James E. Childs, John S. Mackenzie, J. A. Richt, Wildlife and Emerging Zoonotic Diseases: The Biology, Circumstances and Consequences of Cross-Species Transmission, Springer Verlag Science, lk 371, 2007 (vaadatud 14.08.2014)(inglise keeles)
12. Mike Adams, Ebola transmission by aerosols confirmed: virus survives for days outside infected hosts, 1. august 2014 (vaadatud 14.08.2014)(inglise keeles)
13. "EBOLA VARSTI EESTIS?! Vähemasti üks Eesti elanik kaotas haiguse tõttu oma sugulase..." Eesti Ekspress. 14. oktoober 2014. Vaadatud 15.10.2014.

Välislingid

• Ebola Zaire Outbreaks (vaadatud 14.08.2014)(inglise keeles)
• FREDERICK A. MURPHY, GUIDO VAN DER GROEN , SYLVIA G. WHITFIELD , JAMES V. LANGE, EBOLA AND MARBURG VIRUS MORPHOLOGY AND TAXONOMY (vaadatud 6.08.2014)(inglise keeles)
• Sissekanne Microbewiki-s
• Sissekanne andmebaasis NCBI Taxonomy
• Tammy R. Gibb, David A. Norwood, Jr., Neal Woollen, ja Erik A. Henchal, Viral Replication and Host Gene Expression in Alveolar Macrophages Infected with Ebola Virus (Zaire Strain), Clin Diagn Lab Immunol. jaanuar 2002; 9(1): 19–27., doi:10.1128/CDLI.9.1.19-27.2002, PMCID: PMC119875 (vaadatud 29.09.2014)(inglise keeles)
• Tatiana J. Wittmann, Roman Biek, Alexandre Hassanin, Pierre Rouquet, Patricia Reed, Philippe Yaba, Xavier Pourrut, Leslie A. Real, Jean-Paul Gonzalez, ja Eric M. Leroy, Isolates of Zaire ebolavirus from wild apes reveal genetic lineage and recombinants, Proc Natl Acad Sci U S A., 23. oktoober 2007; 104(43): 17123–17127., PMCID: PMC2040453 (vaadatud 6.08.2014)(inglise keeles)
• Daniel R. Beniac, Pasquale L. Melito, Shauna L. deVarennes, Shannon L. Hiebert, Melissa J. Rabb, Lindsey L. Lamboo, Steven M. Jones, Timothy F. Booth,The Organisation of Ebola Virus Reveals a Capacity for Extensive, Modular Polyploidy, DOI: 10.1371/journal.pone.0029608, 11. jaanuar 2012 (vaadatud 10.10.2014)(inglise keeles)
• Adrianna P.P. Zhang, Dafna M. Abelson, Zachary A. Bornholdt, Tong Liu, Virgil L. Woods, Jr, ja Erica Ollmann Saphire, The ebolavirus VP24 interferon antagonist, Virulence. 15. august 2012; 3(5): 440–445., doi:10.4161/viru.21302, PMCID: PMC3485981 (vaadatud 7.10.2014)(inglise keeles)
• Ndongala M. Lubaki, Philipp Ilinykh, Colette Pietzsch, Bersabeh Tigabu, Alexander N. Freiberg, Richard A. Koup ja Alexander Bukreyev, The Lack of Maturation of Ebola Virus-Infected Dendritic Cells Results from the Cooperative Effect of at Least Two Viral Domains, J. Virol. 2013, 87(13):7471. DOI: 10.1128/JVI.03316-12., 24. aprill 2013 (vaadatud 17.08.2014)(inglise keeles)
• Lisa M. Johansen, Jennifer M. Brannan, Sue E. Delos, Charles J. Shoemaker, Andrea Stossel, Calli Lear, Benjamin G. Hoffstrom, Lisa Evans DeWald, Kathryn L. Schornberg, Corinne Scully, Joseph Lehár, Lisa E. Hensley, Judith M. White, ja Gene G. Olinger, FDA-Approved Selective Estrogen Receptor Modulators Inhibit Ebola Virus Infection, Sci Transl Med. Jun 19, 2013; 5(190): 190ra79., doi: 10.1126/scitranslmed.3005471, PMCID: PMC3955358, NIHMSID: NIHMS559803 (vaadatud 20.09.2014)(inglise keeles)
• Deadly Ebola virus reaches Guinea capital Conakry, 23. märts 2014 (vaadatud 24.03.2014)(inglise keeles)
• Baize S, Pannetier D, Oestereich L, Rieger T, Koivogui L, Magassouba N, Soropogui B, Sow MS, Keïta S, De Clerck H, Tiffany A, Dominguez G, Loua M, Traoré A, Kolié M, Malano ER, Heleze E, Bocquin A, Mély S, Raoul H, Caro V, Cadar D, Gabriel M, Pahlmann M, Tappe D, Schmidt-Chanasit J, Impouma B, Diallo AK, Formenty P, Van Herp M, Günther S., Emergence of Zaire Ebola Virus Disease in Guinea – Preliminary Report. Lühikokkuvõte, N Engl J Med., 16. Aprill 2014 (vaadatud 6.08.2014)(inglise keeles)
• Gytis Dudas ja Andrew Rambaut, Phylogenetic Analysis of Guinea 2014 EBOV Ebolavirus Outbreak, 2. mai 2014: ecurrents.outbreaks.84eefe5ce43ec9dc0bf0670f7b8b417d. doi: 10.1371/currents.outbreaks.84eefe5ce43ec9dc0bf0670f7b8b417d, PMCID: PMC4024086 (vaadatud 6.08.2014)(inglise keeles)
• Matti Aivar Lind, Ebola viirus on täielikult kontrolli alt väljunud, www.DELFI.ee 22. juuni 2014 12:23 (vaadatud 22.06.2014)
• Ebolavirus Sequence list, Submitted by Andrew Rambaut on 21.04.2014 (vaadatud 9.08.2014)(inglise keeles)
• Wei Xu, Megan R. Edwards, Dominika M. Borek, Alicia R. Feagins, Anuradha Mittal, Joshua B. Alinger, Kayla N. Berry, Benjamin Yen, Jennifer Hamilton, Tom J. Brett, Rohit V. Pappu, Daisy W. Leung, Christopher F. Basler, Gaya K. Amarasinghe, Ebola Virus VP24 Targets a Unique NLS Binding Site on Karyopherin Alpha 5 to Selectively Compete with Nuclear Import of Phosphorylated STAT1, Cell Host & Microbe 16, 187–200, August 13, 2014, 2014 Elsevier Inc., DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.chom.2014.07.008 (vaadatud 18.09.2014)(inglise keeles)
• Victoria Wahl-Jensen, Sabine Kurz, Friedericke Feldmann, Lukas K. Buehler, Jason, Ebola Virion Attachment and Entry into Human Macrophages Profoundly Effects Early Cellular Gene Expression, PLoS Negl Trop Dis., oktoober 2011; 5(10): e1359., doi:10.1371/journal.pntd.0001359, PMCID: PMC3196478 (vaadatud 7.10.2014)(inglise keeles)
• 12 January 2021, UNICEF, WHO, IFRC and MSF announce the establishment of a global Ebola vaccine stockpile