Tras ser miembro del Partido Radical de Mario Pannunzio, rechazó en 1976 y 1979 la candidatura en el Partido Radical de Marco Pannella. Como independiente de izquierdas en las listas del Partido Comunista Italiano (PCI), fue elegido diputado en 1979, convirtiéndose en miembro de la Comisión de Asuntos Constitucionales. En 1983 fue reelegido y fue nombrado presidente del grupo parlamentario de la Izquierda Independiente.
Diputado por tercera vez en 1987, fue confirmado en la Comisión de Asuntos Constitucionales y formó parte de la Comisión bicameral para las reformas institucionales. En 1989 fue nombrado Ministro de Justicia en el gabinete en la sombra creado por el PCI de Occhetto y posteriormente se adhirió al Partido Democrático de la Izquierda (PDS), del que fue su primer presidente.
En abril de 1992, volvió a la Cámara de Diputados en las filas del PDS, siendo elegido vicepresidente de la Cámara de Diputados y formando parte de la nueva Comisión Bicameral. Al finalizar la legislatura, que duró solo dos años, decidió no volver a ser candidato, prefiriendo volver a la enseñanza universitaria. De 1983 a 1994 fue miembro de la Asamblea parlamentaria del Consejo de Europa. En 1989 fue elegido al Parlamento Europeo.
Ha escrito numerosos libros y ensayos, traducidos al inglés, francés, alemán, español y portugués. Entre los más importantes están:
Il problema della responsabilità civile (1964);
Le fonti di integrazione del contratto (1969);
Il diritto privato nella società moderna (1971);
Elaboratori elettronici e controllo sociale (1973);
Alla ricerca delle libertà (1978);
Il terribile diritto. Studi sulla proprietà privata (1990, 2 ed.);
El terrible derecho: estudios sobre la propiedad privada (1986);
Tecnologie e diritti (1995);
Libertà e diritti in Italia dall'Unità ai giorni nostri (1997);
Repertorio di fine secolo (1999, 2 ed.);
Tecnopolitica. La democrazia e le nuove tecnologie dell'informazione (2004, 2. ed.);
Intervista su privacy e libertà (2005);
La vita e le regole. Tra diritto e non diritto (2006, nueva ed. ampliada 2009);
La vida y las reglas: entre el derecho y el no derecho (2010);
Dal soggetto alla persona (2007);
Ideologie e tecniche della riforma del diritto civile (2007);
Perché laico (2009, nueva ed. ampliada 2010).
Che cos'é il corpo (2010).
Il nuovo habeas corpus e Il corpo giuridificato, in Trattato di biodiritto (2010);
Diritti e libertà nella storia d'Italia. Conquiste e conflitti 1861-2011 (2011);
Elogio del moralismo (2011);
Il diritto di avere diritti (2012);
(presentación de) Democrazia senza partiti (2013);
La rivoluzione della dignità, Napoli, La scuola di Pitagora (2013);
Il mondo nella rete. Quali i diritti, quali i vincoli (2014);
Solidarietà. Un'utopia necessaria (2014);
Diritto e giustizia: interroghiamo la Costituzione (2015).
Revistas y colaboraciones
Ha dirigido Il diritto dell'agricoltura y las revistas Politica del diritto y Rivista critica del diritto privato. Ha colaborado en diversos periódicos y revistas; entre ellos: Il Mondo, Nord e Sud, Il Giorno, Panorama, il Manifesto, L'Unità, la Repubblica.
«Stefano Rodotà». Enciclopedia Multimediale delle Scienze Filosofiche(en italiano). Archivado desde el original el 4 de mayo de 2008. Consultado el 18 de mayo de 2008.