Posteriormente hizo estudios de teología en el Estudio Teológico "San Ildefonso", [1] de Toledo, y en la Pontificia Universidad Gregoriana de Roma, donde obtuvo la licenciatura en teología bíblica en 1996 y el doctorado en 2006.
En 1998 comienza a prestar servicio en la Santa Sede en el Consejo Pontificio de la Cultura, primero como encargado del diálogo ciencia-fe y desde 2004 como subsecretario del Consejo.
Es autor de diversos artículos y obras relativos al diálogo entre la cultura y la fe, con especial referencia a las ciencias naturales. Ha escrito también acerca de Galileo Galilei y la Iglesia católica.