De acuerdo con la ley de sucesión, que debía evitar la división del territorio, Guillermo era el sucesor legítimo de su padre, pero su madre insistió en que su hermano, Luis X, también sería duque. Más tarde resultó que Luis tenía poco interés en los asuntos gubernamentales y prefería llevar una vida feliz, por lo que en la práctica Guillermo gobernaría ambos territorios. Él y María Jacoba vivían en la casa de verano Lusthaus, donde tenían una extensa colección de arte. Tras la muerte de Luis en 1545, Baviera se reunifico por última vez bajo el mandato de Guillermo.
Viudez y muerte
Viuda en 1550, se cree que vivió con discreción en la corte bávara los treinta años que sobrevivió a su marido. Murió en 1580, cuando también ya había sobrevivido a sus hijos.
Bibliografía
Hans and Marga Rall: Die Wittelsbacher – Von Otto I. bis Elisabeth I., Weltbild (1994)